Особенности состава микробиоты кишечника у пациентов с алкогольным циррозом печени
- Авторы: Шаликиани НВ1, Бакулин ИГ1, Дубинкина ВБ2, Ищенко ДС3,4, Алексеев ДГ3,4, Тяхт АВ3,4, Павленко АВ5,4, Ильина ЕН6, Кострюкова ЕС2, Тараскина АЕ6, Скородумова ЛО6, Маев ИВ7, Говорун ВМ3,4
-
Учреждения:
- «Московский клинический научно-практический центр» Департамента здравоохранения города Москвы
- «Московский физико-технический институт»
- «Московский физико-технический институт», Долгопрудныйя
- «НИИ физико-химической медицины» ФМБА России, Москва
- «Московский физико-технический институт», Долгопрудный
- «НИИ физико-химической медицины» ФМБА России
- «Московский государственный медико-стоматологический университет им. А.И. Евдокимова» Минздрава России
- Выпуск: Том 87, № 12 (2015)
- Страницы: 59-65
- Раздел: Передовая статья
- Статья получена: 10.04.2020
- Статья опубликована: 15.12.2015
- URL: https://ter-arkhiv.ru/0040-3660/article/view/31877
- ID: 31877
Цитировать
Полный текст
Аннотация
Ключевые слова
Об авторах
Н В Шаликиани
«Московский клинический научно-практический центр» Департамента здравоохранения города МосквыМосква, Россия
И Г Бакулин
«Московский клинический научно-практический центр» Департамента здравоохранения города МосквыМосква, Россия
В Б Дубинкина
«Московский физико-технический институт»Долгопрудный, Россия
Д С Ищенко
«Московский физико-технический институт», Долгопрудныйя; «НИИ физико-химической медицины» ФМБА России, Москва
Д Г Алексеев
«Московский физико-технический институт», Долгопрудныйя; «НИИ физико-химической медицины» ФМБА России, Москва
А В Тяхт
«Московский физико-технический институт», Долгопрудныйя; «НИИ физико-химической медицины» ФМБА России, Москва
А В Павленко
«Московский физико-технический институт», Долгопрудный; «НИИ физико-химической медицины» ФМБА России, Москва
Е Н Ильина
«НИИ физико-химической медицины» ФМБА РоссииМосква, Россия
Е С Кострюкова
«Московский физико-технический институт»Долгопрудный, Россия
А Е Тараскина
«НИИ физико-химической медицины» ФМБА РоссииМосква, Россия
Л О Скородумова
«НИИ физико-химической медицины» ФМБА РоссииМосква, Россия
И В Маев
«Московский государственный медико-стоматологический университет им. А.И. Евдокимова» Минздрава РоссииМосква, Россия
В М Говорун
«Московский физико-технический институт», Долгопрудныйя; «НИИ физико-химической медицины» ФМБА России, Москва
Список литературы
- World Health Organization et al. Global status report on alcohol and health-2014. World Health Organization; 2014.
- Gramenzi A, Caputo F, Biselli M et al. Review article: alcoholic liver disease — pathophysiological aspects and risk factors. Alimentary Pharmacology and Therapeutics. 2006;24(8):1151-1161. doi: 10.1111/j.1365-2036.2006.03110.x.
- Atkinson K, Rao R. Role of protein tyrosine phosphorylation in acetaldehyde-induced disruption of epithelial tight junctions. Am J Physiol Gastrointest Liver Physiol. 2001;280:1280-1288.
- Bull-Otterson L, Feng W, Kirpich I et al. Metagenomic Analyses of Alcohol Induced Pathogenic Alterations in the Intestinal Microbiome and the Effect of Lactobacillus rhamnosus GG Treatment. PLoSONE. 2013;8(1):e53028. doi: 10.1371/journal.pone.0053028.
- Bajaj J, Heuman D, Hylemon P et al. Altered profile of human gut microbiome is associated with cirrhosis and its complications. Journal of Hepatology. 2014;60(5):940-947. doi: 10.1016/j.jhep.2013.12.019.
- Chen Y, Yang F, Lu H et al. Characterization of fecal microbial communities in patients with liver cirrhosis. Hepatology. 2011;54(2):562-572. doi: 10.1002/hep.24423.
- Mutlu E, Gillevet P, Rangwala H et al. Colonic microbiome is altered in alcoholism. AJP: Gastrointestinal and Liver Physiology. 2012;302(9):G966-G978. doi: 10.1152/ajpgi.00380.2011.
- Liu Q, Duan Z, Ha D, Bengmark S, Kurtovic J, Riordan S. Synbiotic modulation of gut flora: Effect on minimal hepatic encephalopathy in patients with cirrhosis. Hepatology. 2004;39(5):1441-1449. doi: 10.1002/hep.20194.
- Leclercq S, Matamoros S, Cani P et al. Intestinal permeability, gut-bacterial dysbiosis, and behavioral markers of alcohol-dependence severity. Proceedings of the National Academy of Sciences. 2014;111(42):E4485-E4493. doi: 10.1073/pnas.1415174111.
- Qin N, Yang F, Li A et al. Alterations of the human gut microbiome in liver cirrhosis. Nature. 2014;513(7516):59-64. doi: 10.1038/nature13568.
- Miller TL, Wolin MJ. Fermentations by saccharolytic intestinal bacteria. The American Journal of Clinical Nutrition. 1979;32(1):164-172.
- Nosova T. Acetaldehyde production and metabolism by human indigenous and probiotic lactobacillus and bifidobacterium strains. Alcohol and Alcoholism. 2000;35(6):561-568. doi: 10.1093/alcalc/35.6.561.
- Tyakht A, Popenko A, Belenikin M, Altukhov I, Pavlenko A, Kostryukova E, Selezneva O, Larin A, Karpova I, Alexeev D. MALINA: a web service for visual analytics of human gut microbiota whole-genome metagenomic reads. Source Code Biol Med. 2012;7(1):13. doi: 10.1186/1751—0473-7-13.
- Tyakht A, Kostryukova E, Popenko A, Belenikin M, Pavlenko A, Larin A, Karpova I, Selezneva O, Semashko T, Ospanova E, Babenko V, Maev I, Cheremushkin S, Kucheryavyy Y, Shcherbakov P, Grinevich V, Efimov O, Sas E, Abdulkhakov R, Abdulkhakov S, Lyalyukova E, Livzan M, Vlassov V, Sagdeev R,Tsukanov V, Osipenko M, Kozlova I, Tkachev A, Sergienko V, Alexeev D, Govorun V. Human gut microbiota community structures in urban and rural populations in Russia. Nature Communications. 2013;4:2469. doi: 10.1038/ncomms3469.
- Qin J, Li R, Raes J et al. A human gut microbial gene catalogue established by metagenomic sequencing. Nature. 2010;464(7285): 59-65. doi: 10.1038/nature08821.
- Huttenhower C, Gevers D, Knight R et al. Structure, function and diversity of the healthy human microbiome. Nature. 2012;486(7402):207-214. doi: 10.1038/nature11234.
- Qin J, Li Y, Cai Z et al. A metagenome-wide association study of gut microbiota in type 2 diabetes. Nature. 2012;490(7418):55-60. doi: 10.1038/nature11450.
- Kanehisa M. The KEGG database. Silico simulation of biological processes. 2002;247:91-103.
- Segata N, Waldron L, Ballarini A, Narasimhan V, Jousson O, Huttenhower C. Metagenomic microbial community profiling using unique clade-specific marker genes. Nature Methods. 2012;9(8):811-814. doi: 10.1038/nmeth.2066.
- Langmead B, Trapnell C, Pop M, Salzberg S. Ultrafast and memory-efficient alignment of short DNA sequences to the human genome. Genome Biol. 2009;10(3):R25. doi: 10.1186/gb-2009-10-3-r25.
- Кострюкова Е.С., Карпова И.Ю., Ларин А.К., Попенко А.С., Тяхт А.В., Ильина Е.Н. Вариабельность относительного содержания геномной ДНК человека при метагеномном анализе микробиоты кишечника. Биомедицинская химия. 2014;60(6):695-701. doi: 10.18097/pbmc20146006695.
- Gevers D, Kugathasan S, Denson L et al. The Treatment-Naive Microbiome in New-Onset Crohn’s Disease. Cell Host & Microbe. 2014;15(3):382-392. doi: 10.1016/j.chom.2014.02.005.
- Taur Y, Xavier J, Lipuma L et al. Intestinal Domination and the Risk of Bacteremia in Patients Undergoing Allogeneic Hematopoietic Stem Cell Transplantation. Clinical Infectious Diseases. 2012;55(7):905-914. doi: 10.1093/cid/cis580.
- Ferrier L, Bérard F, Debrauwer L et al. Impairment of the Intestinal Barrier by Ethanol Involves Enteric Microflora and Mast Cell Activation in Rodents. The American Journal of Pathology. 2006;168(4):1148-1154. doi: 10.2353/ajpath.2006.050617.
Дополнительные файлы
![](/img/style/loading.gif)