Изменчивость генома HCV у больных вирусным гепатитом C в острую и хроническую фазы инфекции
- Авторы: Ющук НД1, Климова ЕА1, Знойко ОО1, Гаджикулиева ММ1, Ильина ЕН1, Яшина ТЛ1, Малышев НА1, Цыганова ЕВ1, Yuschuk ND1, Klimova EA1, Znoiko OO1, Gadzhikulieva MM1, Ilyina EN1, Yashina TL1, Malyshev NA1, Tsyganova EV1
-
Учреждения:
- Выпуск: Том 81, № 4 (2009)
- Страницы: 47-54
- Раздел: Передовая статья
- Статья получена: 09.04.2020
- Статья опубликована: 15.04.2009
- URL: https://ter-arkhiv.ru/0040-3660/article/view/30313
- ID: 30313
Цитировать
Полный текст
Аннотация
Материалы и методы. Под наблюдением находились 10 больных желтушной формой острого гепатита C и 16 больных хроническим гепатитом C, полностью резистентных к терапии интерфероном. Антитела к HCV определяли с помощью набора VBI HCV EIA 4.0 ("Organon Teknika"). РНК HCV в сыворотке крови выявляли у всех больных в период разгара болезни и далее в течение 12 мес наблюдения. Выделение и детекцию РНК HCV проводили набором "Полигеп С" (НПФ "Литех"), количественное определение РНК HCV - с помощью набора Amplicor HCV monitor test ("Roche"), амплификацию фрагмента генома HCV, включающего HVR1-область размером 351 п. н., проводили методом "гнездовой" ПЦР со стадией обратной транскрипции, определение генотипа HCV - методом SSCP, а также путем прямого ферментативного секвенирования NS5A области генома HCV с использованием реагента Big Dye DNA Sequencing Kit на секвенаторе 377 ABI с последующим выявлением аминокислотных замен в NS5A-регионе.
Результаты. Выявлены генетическая неоднородность и изменчивость индивидуальной популяции HCV, циркулирующей в крови больных острым гепатитом C, наблюдаемые как при 1в-, так и при 2а- и 3а-генотипах. Изменчивость HCV не зависела от уровня вирусной нагрузки. Изменение генетической структуры HCV было существенным у больных со значительными колебаниями активности аланинаминотрансферазы (АЛТ) и у пациентов со стойко нормальной активностью АЛТ, при этом среднее число генетических вариантов HCV в сравниваемых группах не различалось. Не обнаружено достоверной корреляции между концентрацией вируса в крови больного, его изменчивостью и активностью АЛТ. Исследование показало, что в 25% случаев у больных хроническим гепатитом C не выявлено мутаций в ISDR-регионе, в 75% случаев выявлены 1-3 замены аминокислотных последовательностей, а наиболее частой мутацией является наличие замен в позиции 2218 (гистидин/аргинин).
Заключение. Показано, что генетическая неоднородность и изменчивость индивидуальной популяции HCV, циркулирующей в сыворотке крови, не могут являться прогностическим критерием при оценке вариантов течения острого гепатита C. Результаты, полученные при исследовании генетической гетерогенности интерферончувствительного региона гена NS5A субтипа 1b HCV больных хроническим гепатитом C, частично согласуются с результатами, полученными как на японской, так и на европейской популяции, так как у пациентов Московского региона, резистентных к интерферону, в 25% случаев не выявлена мутационная изменчивость ISDR, как и в японской популяции, однако преобладает промежуточный тип изменчивости, что характерно для европейской популяции.
Об авторах
Н Д Ющук
Е А Климова
О О Знойко
М М Гаджикулиева
Е Н Ильина
Т Л Яшина
Н А Малышев
Е В Цыганова
N D Yuschuk
E A Klimova
O O Znoiko
M M Gadzhikulieva
E N Ilyina
T L Yashina
N A Malyshev
E V Tsyganova
Список литературы
- Choo Q. L., Kuo G., Weiner A. J. et al. Isolation of a cDNA clone derived from a blood-borne non-A, non-B viral hepatitis genome. Science 1989; 244: 359-362.
- Clarke B. Molecular virology of hepatitis C virus. J. Gen. Virol. 1997; 78: 2397-2410.
- Purcell R. The hepatitis C virus: overview. Hepatology 1997; 26 (3, suppl. 1): 134-143.
- Farci P. Hepatitis C virus. The importance of viral heterogeneity. Clin. Liver Dis. 2001; 5 (4): 895-916.
- Enomoto N., Sakuma I., Asahina Y. et al. Comparison of full-length sequences of interferon-sensitive and resistant hepatitis C virus 1b. Sensitivity to interferon is conferred by amino acid substitutions in the NS5A gene. J. Clin. Invest. 1995; 96: 224-230.
- Enomoto N., Sakuma I., Asahina Y. et al. Mutations in the nonstructural protein 5A gene and response to interferon in patients with chronic hepatitis C virus 1b infection. N. Engl. J. Med. 1996; 334 (2): 77-81.
- Kurosaki M., Enomoto N., Murakami T. et al. Analysis of genotypes and amino acid residues 2209 to 2248 of the NS5A region of hepatitis C virus in relation to the response to interferon-beta therapy. Hepatology 1997; 25 (3): 750-753.
- Khorsi H., Castelain S., Wyseur A. et al. Mutations of hepatitis C virus 1b NS5A 2209-2248 amino acid sequence do not predict the response to recombinant interferon-alfa therapy in French patients. J. Hepatol. 1997; 27: 72-77.
- McKechnie V. M., Mills P. R., McCruden E. A. The NS5a gene of hepatitis C virus in patients treated with interferon-alpha. J. Med. Virol. 2000; 60 (4): 367-378.
- Pawlotsky J. M., Germanidis G., Neumann A. U. et al. Interferon resistance of hepatitis C virus genotype 1b: Relationship to nonstructural 5A gene quasispecies mutations. J. Virol. 1998; 72: 2795-2805.
- Saiz J. C., Lopez Labrador F. X. et al. The prognostic relevance of the nonstructural 5A gene interferon sensitivity determining region is different in infections with genotype 1b and 3a isolates of hepatitis C virus. J. Infect. Dis. 1998; 177: 839-847.
- Watanabe H., Enomoto N., Nagayama K. et al. Number and position of mutations in the interferon (IFN) sensitivity-determining region of the gene for nonstructural protein 5A correlate with IFN efficacy in hepatitis C virus genotype 1b infection. J. Infect. Dis. 2001; 183: 1195-1203.
- Wohnsland A., Hofmann W. P., Sarrazin C. Viral determinants of resistance to treatment in patients with hepatitis C. Clin. Microbiol. Rev. 2007; 20 (1): 23-38.
- Zeuzem S., Lee J. H., Roth W. K. Mutations in the nonstructural 5A gene of European hepatitis C virus isolates and response to interferon alfa. Hepatology 1997; 25: 740-744.
- Pascu M., Martus P., Hцhne M. et al. Sustained virological response in hepatitis C virus type 1b infected patients is predicted by the number of mutations within the NS5A-ISDR: a meta-analysis focused on geographical differences. Gut 2004; 53 (9): 1345-1351.
Дополнительные файлы
![](/img/style/loading.gif)