Dynamics of hospital mortality in COVID-19 pandemia
- Authors: Gareeva D.F.1, Lakman I.A.2, Agapitov A.A.2, Sadikova L.F.2, Davtian P.A.1, Kayumova V.L.1, Nurtdinova G.M.1, Badykova E.A.1, Kurbanov M.S.1, Idigov I.R.1, Fiedler L.3, Motloch L.4,5,6, Dieplinger А.7, Timiryanova V.M.2, Zagudullin N.S.1
-
Affiliations:
- Bashkir State Medical University
- Ufa University of Science and Technology
- Landesklinikum Wiener Neustadt
- Clinic II for Internal Medicine, University Hospital Salzburg, Paracelsus Medical University
- Department of Internal Medicine II, Salzkammergut Klinikum
- Johannes Kepler University, Department of Cardiology, Kepler University Hospital, Medical Faculty
- Institute for Nursing Science and Practice, Paracelsus Medical University
- Issue: Vol 96, No 1 (2024)
- Pages: 29-35
- Section: Original articles
- URL: https://ter-arkhiv.ru/0040-3660/article/view/568620
- DOI: https://doi.org/10.26442/00403660.2024.01.202558
- ID: 568620
Cite item
Full Text
Abstract
Background. During the pandemic of coronavirus infection (COVID-19) caused by a virus SARS-CoV-2 there has been significant variability in symptoms of the disease over time, severity of the course and in particular hospital mortality. Several SARS-CoV-2 variants have been identified such as Alpha, Delta, Omicron and others.
Aim. To investigate the hospital mortality in patients with different strain variants during the period from April 2020 to April 2022. All included patients had moderate to severe COVID-19-associated pneumonia requiring hospitalization.
Materials and methods. In this retrospective, conclusive, non-randomized, non-controlled study 4854 clinical records of hospitalized patients with Alpha (n=2400, April – December 2020), Delta (n=1722, 2021) and Omicron (n=627, January – April 2022) variants were investigated.
Results. Hospital mortality is 6% in Alpha variant patients (6%), 5.7% in Delta and significantly lower in Omicron (1.5%; p<0,001). Cardiovascular disease (arterial hypertension, coronary heart disease, chronic heart failure), diabetes mellitus and chronic kidney disease were risk factors for death in Alpha and Delta, but not in Omicron. There was also a significant decrease in the duration of hospitalization with strains Delta [7 days (5; 9)] and Omicron [7 (5; 11)] compared with Alpha [11 (9; 13); p<0,001], and differences in factors the risk of mortality between the tested COVID variants.
Conclusion. Thus, differences in mortality and risk factors for death between COVID-19 variants could be shown in our cohort.
Keywords
Full Text
Список сокращений
АГ – артериальная гипертензия
ИБС – ишемическая болезнь сердца
ИМ – инфаркт миокарда
ИМТ – индекс массы тела
СД – сахарный диабет
ХБП – хроническая болезнь почек
ХОБЛ – хроническая обструктивная болезнь легких
ХСН – хроническая сердечная недостаточность
COVID-19 – коронавирусная инфекция, вызванная вирусом SARS-CoV-2
Введение
За 3 года пандемии коронавирусной инфекции (COVID-19), вызванной вирусом SARS-CoV-2, в мире подтверждено более 6,5 млрд случаев заболевания и более 6 млн летальных исходов [1]. Уровень госпитализации и смертности от COVID-19 составил 1–4%. Хотя SARS-CoV-2 демонстрирует более низкую частоту мутаций по сравнению с другими вирусами, геном которых представлен рибонуклеиновой кислотой (РНК-вирусы), включая грипп и вирус иммунодефицита человека, во всем мире выявлено более 1800 мутаций [2, 3]. За время пандемии вирус SARS-CoV-2 прошел определенную эволюцию с развитием древа генотипов [4]. Первым штаммом, который появился в г. Ухань и являлся максимально активным в России в 2020 г., является Альфа. Так называемый штамм Дельта (2021 г.) обладал более высокой потенциальной способностью к передаче, что обусловило, в том числе, распространение повторного инфицирования. Мутаций в штамме Омикрон, который появился в конце 2021 г., было больше, чем в любом предыдущем штамме вируса, – почти 50, из которых более 26 приходится на область его спайкового белка, что отражало процесс интенсивной мутации и адаптации к человеческому организму [5]. В литературе приведены исследования разных волн популяций, начиная с жалоб, клинических симптомов, частоты госпитализации и смертности [6, 7]. Однако в настоящее время отсутствует достоверная характеристика различий в госпитальной смертности у пациентов с различными штаммами COVID-19.
Цель – изучить госпитальную смертность у пациентов с COVID-19-ассоциированной пневмонией при разных вариантах (Альфа, Дельта и Омикрон) в динамике пандемии.
Материалы и методы
В ретроспективном нерандомизированном неконтролируемом сплошном исследовании изучено 4749 историй болезни пациентов, госпитализированных в ковидные госпитали г. Уфы (Клиника ФГБОУ ВО БГМУ и ГБУЗ ГКБ №3) в 2020–2022 гг. За 2020 г. госпитализированы 2440 пациентов, в основном с вариантом Альфа, за 2021 г. – 1722, преимущественно с вариантом Дельта, а за 2022 г. – 627, с преобладанием варианта Омикрон. Все включенные пациенты были старше 18 лет и имели COVID-19-ассоциированную пневмонию средней и тяжелой степеней тяжести, требующую госпитализации.
Первоначальный диагноз установлен с помощью сбора анамнеза, клинического исследования, компьютерной томографии, теста, проведенного методом полимеразной цепной реакции, определения специфических антител к COVID-19 при поступлении в соответствии с действующими в Российской Федерации рекомендациями по данному заболеванию. Неотложная медикаментозная терапия, включая противовирусную, проведена в соответствии с принятыми на момент болезни пациентов рекомендациями Минздрава России. Постановку дальнейшего актуального диагноза осуществляли на основании данных анамнеза, клинических симптомов и других инструментальных и лабораторных исследований при необходимости.
Дизайн исследования представлен на рис. 1.
Рис. 1. Дизайн исследования.
Подробная история болезни получена при поступлении, включая текущие клинические симптомы, а также сведения о данном и сопутствующих заболеваниях, лекарственной терапии.
Конечной точкой исследования принята госпитальная летальность.
Вариант вируса определяли в тот или иной период времени в соответствии с отчетами регионального отделения Федеральной службы по надзору в сфере здравоохранения. Вариант Альфа устанавливали с начала открытия COVID-госпиталя в Клинике БГМУ с апреля по декабрь 2020 г., Дельта – с января по декабрь 2021 г., Омикрон – с января по апрель 2022 г.
Все пациенты подписывали информированное согласие для участия в исследовании. Протокол исследования одобрен локальным этическим комитетом по ФГБОУ ВО БГМУ по клиническим дисциплинам (№9 от 17 декабря 2021 г.).
Статистика. Для представления характеристик пациентов 3 групп использовали медиану (Me) и межквартильный интервал (Q1–Q3) для непрерывных числовых признаков, абсолютные и относительные частоты для номинальных признаков, %. Для оценки различий в характеристиках применяли тесты Мана–Уитни (для непрерывных числовых признаков) и χ2-критерий для частот встречаемости (в том числе с поправкой Йейтса в случае, если в одной из групп сравнения признак наблюдали редко, т.е. менее 5%, или вовсе не наблюдали). Считали, что различия значимы, если р-уровень отклонения нулевой гипотезы об их отсутствии не превышал 0,05.
Для определения различий в госпитальной смертности использовали множительные оценки Каплана–Мейера, при этом для расчета доверительных интервалов применяли метод Гринвуда. Для оценки различий в выживаемости в 3 группах применяли логранговый критерий.
Для выявления предикторов риска госпитальной смертности использовали унивариантные (однофакторные) регрессионные модели выживаемости Кокса следующего вида:
где h(t|xi) – риск смерти в период t при условии воздействия предиктора xi, h0 (t) – базовый риск смерти (риск, который существует без влияния факторов), p – коэффициент риска, оцениваемый методом частичного правдоподобия. Здесь под предикторами риска xi рассматривали как бинарные переменные, такие как мужской пол, наличие артериальной гипертензии (АГ), сахарного диабета (СД), хронической болезни почек (ХБП), хронической сердечной недостаточности (ХСН), ишемической болезни сердца (ИБС), хронической обструктивной болезни легких (ХОБЛ), инфаркта миокарда (ИМ), инсульта, так и числовые признаки, в частности возраст, индекс массы тела (ИМТ).
Для интерпретации результатов моделирования на основе полученных оценок коэффициентов β рассчитывали отношение рисков (HR) по формуле:
Для отношения рисков рассчитывали доверительный интервал с надежностью 95%. Все статистические расчеты проводили с использованием языка R.
Результаты
Таблица 1. Клинико-демографическая характеристика пациентов в 3 вариантах COVID-19 Table 1. Clinical and demographic characteristics of patients in 3 variants of COVID-19 | |||||
Параметр | Вся когорта, N=5224 | Альфа, n1=2400 | Дельта, n2=1827 | Омикрон, n3=627 | p-уровень |
Характеристика признаков Ме (Q1; Q3), различия согласно тесту Манна–Уитни (р1 – между вариантами Альфа и Дельта, р2 – между вариантами Дельта и Омикрон, р3 – между вариантами Омикрон и Альфа) | |||||
Возраст, лет | 59,5(49; 70) | 59(48; 67) | 62(40; 70) | 66(45,5; 74) | p1=0,855 p2<0,001*** p3<0,001*** |
Продолжительность госпитализации, дни | 9(6; 12) | 11(9; 13) | 7(5; 9) | 7(5; 11) | p1<0,001*** p2=0,011 p3<0,001*** |
Рост, см | 166(160; 172) | 166(160; 173) | 165(159; 171) | 164(158; 170) | p1<0,001*** p2=0,029* p3<0,001*** |
Вес, кг | 77,5(67; 88) | 78(69; 90) | 77(67; 88) | 72(63; 83) | p1=0,001** p2<0,001*** p3<0,001*** |
ИМТ, кг/м2 | 28(24; 31) | 28(25; 31) | 27(24; 31) | 27(23; 31) | p1=0,067 p2<0,001*** p3<0,001*** |
Характеристика частоты встречаемости факторов риска, абс. (%), различия согласно χ2-критерию (р1 – между вариантами Альфа и Дельта, р2 – между вариантами Дельта и Омикрон, р3 – между вариантами Омикрон и Альфа) | |||||
Пол, м/ж | 1902/3368
| 1055/1386 (43,2/56,8) | 622/1210 (33,9/66,1) | 219/408 (34,9/65,1) | p1<0,001*** p2=0,657 p3<0,001*** |
АГ | 2411(46,2) | 958(39,9) | 1048(57,4) | 359(57,3) | p1<0,001*** p2=0,964 p3<0,001*** |
СД | 681 (13) | 311 (12,9) | 256 (14) | 96 (15,3) | p1=0,320 p2=0,424 p3=0,125 |
ХБП | 135 (2,6) | 95 (3,9) | 19 (1) | 21 (3,3) | p1<0,001*** p2<0,001*** p3=0,480 |
ИБС | 719 (13,8) | 254 (10,6) | 363 (19,9) | 89 (14,2) | p1<0,001*** p2=0,002** p3=0,012* |
Перенесенный ИМ | 175 (3,3) | 72 (3) | 70 (3,8) | 28 (4,5) | p1=0,138, p2=0,484 p3=0,068 |
ХСН | 366 (7) | 229 (9,5) | 105 (5,7) | 31(4,9) | p1<0,001*** p2=0,449 p3<0,001*** |
Перенесенный инсульт | 128 (2,5) | 46 (1,9) | 66 (3,6) | 16 (2,6) | p1<0,001*** p2=0,203 p3=0,318 |
ХОБЛ | 242 (4,6) | 87 (3,6) | 108 (5,9) | 43 (6,9) | p1<0,001*** p2=0,395 p3<0,001*** |
Здесь и далее в табл. 2: *, **, *** – различия значимы при уровне p<0,05, p<0,01 и p<0,001 соответственно. |
Всех пациентов распределили на 3 группы в зависимости от преобладающего штамма: Альфа, Дельта и Омикрон. Результаты простого статистического сравнения (табл. 1) показали, что различия в возрасте между пациентами волн Альфа и Дельта отсутствуют, но пациенты, госпитализированные в волну Омикрон, являлись значимо старше (p<0,001). Самая большая продолжительность госпитализации выявлена у пациентов, госпитализированных в волну Альфа, самая меньшая – в волну Дельта (p<0,001). Примечательно, что в среднем по росту, весу и, соответственно, по ИМТ пациенты 3 волн имели существенные различия (p<0,05). По половому составу госпитализированные также различались: доля мужчин для волны Альфа составила 43%, что значимо больше, чем для волн Дельта и Омикрон (p<0,001). В волнах Дельта и Омикрон чаще госпитализировали пациентов с наличием АГ (p<0,001), ХБП (p<0,001), ИБС (p<0,001) и ХОБЛ (p<0,001). Встречаемость ХСН значимо чаще наблюдали у пациентов в волну Альфа (p<0,001), а перенесенный инсульт в анамнезе – в волну Дельта (p<0,001). По частоте наличия СД у госпитализированных и ИМ в анамнезе группы между собой не имели различий (p>0,1).
Таблица 2. Характеристика выживших и умерших в госпитале пациентов в группах Альфа, Дельта и Омикрон Table 2. Characteristics of patients who survived and died in the hospital in the Alpha, Delta and Omicron groups | ||||||
Параметр | Альфа, n1=2400 | Дельта, n2=1827 | Омикрон, n3=627 | |||
выжившие | умершие | выжившие | умершие | выжившие | умершие | |
2255 (94) | 145 (6) | 1722 (94,3) | 105 (5,7) | 618 (98,5) | 9 (1,5) | |
Характеристика признаков Ме (Q1; Q3), различия согласно тесту Манна–Уитни | ||||||
Возраст, лет | 58 (48; 60) | 70 (63; 75) | 59 (49; 69) | 74 (66; 82) | 66 (45; 74) | 76 (63; 82) |
р<0,001*** | р<0,001*** | р<0,001*** | р<0,001*** | р=0,033 | р=0,033 | |
Продолжительность госпитализации, дни | 11 (9; 13) | 11 (7; 17) | 7 (5; 9) | 12 (7; 17) | 7 (5; 11) | 7 (6; 12) |
р=0,642 | р=0,642 | р<0,001*** | р<0,001*** | р=0,696 | р=0,696 | |
Рост, см | 166 (160; 173) | 167 (160; 173) | 165 (159; 171) | 163 (156; 170) | 164 (158; 170) | 168 (165; 170) |
р=0,507 | р=0,507 | р=0,038* | р=0,038* | р=0,315 | р=0,315 | |
Вес, кг | 78 (69; 90) | 90 (72; 96) | 77 (67; 88) | 81 (68; 94) | 73 (63; 83) | 70 (61; 70) |
р=0,055 | р=0,055 | р=0,044* | р=0,044* | р=0,139 | р=0,139 | |
ИМТ, кг/м2 | 28 (25; 31) | 29 (25; 32) | 28 (24; 31) | 29 (25; 32) | 27 (23,5; 31) | 24 (22,5; 24) |
р=0,183 | р=0,183 | р=0,183 | р=0,183 | р=0,096 | р=0,096 | |
Характеристика частоты встречаемости, абс. (%) | ||||||
Пол, м/ж | 955/1300 (42,4/57,6) | 79/66 (54,5/45,5) | 582/1140 (33,8/66,2) | 38/67 (36,2/63,8) | 213/405 (34,5/65,5) | 6/3 (66,6/33,4) |
р=0,005** | р=0,005** | р=0,616 | р=0,616 | р=0,045* | р=0,045* | |
АГ | 880 (39) | 80 (55,2) | 969 (56,3) | 79 (75,2) | 353 (57,1) | 6 (66,7) |
р<0,001*** | р<0,001*** | р<0,001*** | р<0,001*** | р=0,566 | р=0,566 | |
СД | 269 (11,9) | 43 (29,7) | 233 (13,5) | 23 (21,9) | 94 (15,2) | 2 (22,2) |
р<0,001*** | р<0,001*** | р=0,017* | р=0,017* | р=0,562 | р=0,562 | |
ХБП | 84 (3,7) | 11 (7,6) | 15 (0,87) | 4 (3,8) | 21 (3,4) | 0 |
р=0,021* | р=0,021* | р=0,018*, # | р=0,018*, # | р=0,511# | р=0,511# | |
ИБС | 211 (9,4) | 43 (29,7) | 328 (19,0) | 35 (33,3) | 88 (14,2) | 1 (11,1) |
р<0,001*** | р<0,001*** | р<0,001*** | р<0,001*** | р=0,831# | р=0,831# | |
Перенесенный ИМ | 64 (2,8) | 8 (5,5) | 64 (3,7) | 6 (5,7) | 27 (4,4) | 1 (11,1) |
р=0,067 | р=0,067 | р=0,301 | р=0,301 | р=0,874# | р=0,874# | |
ХСН | 189 (8,4) | 40 (27,6) | 100 (5,8) | 5 (4,8) | 30 (4,9) | 1 (11,1) |
р<0,001*** | р<0,001*** | р=0,818# | р=0,818# | р=0,933# | р=0,933# | |
Перенесенный инсульт | 40 (1,8) | 6 (4,1) | 60 (3,5) | 6 (5,7) | 16/602 | 0 |
р=0,045* | р=0,045* | р=0,235 | р=0,235 | р=0,565# | р=0,565# | |
ХОБЛ | 75 (3,3) | 12 (8,3) | 99 (5,7) | 9 (8,6) | 42 (6,8) | 1 (11,1) |
р=0,002** | р=0,002** | р=0,234 | р=0,234 | р=0,877# | р=0,877# | |
#При оценке различий использовали поправку Йейтса. |
Анализ характеристик выживших и умерших в госпитале пациентов всех 3 волн (табл. 2) показал значимое их различие по возрасту: умершие пациенты в среднем всегда были старше. Выжившие и умершие пациенты волны Дельта значимо различались по продолжительности госпитализации, а также по росту и весу: умершие имели меньший рост и больший вес. Пациенты мужского пола значимо чаще умирали в волнах Альфа (p<0,01) и Омикрон (p<0,05). В волнах Альфа и Дельта чаще летальный исход фиксировали у пациентов с АГ (p<0,001), ИБС (p<0,001), ХБП (p<0,05), СД (p<0,001 и p<0,05 соответственно). Умершие пациенты, госпитализированные в волну Альфа, чаще имели в анамнезе ХСН (p<0,001), инсульт (p<0,05) и ХОБЛ (p<0,01).
Множительные оценки Каплана–Мейера госпитальной летальности в волнах Альфа, Дельта и Омикрон показали значимые различия (p<0,001); рис. 2. Такой же вывод подтвердил логранговый критерий. Различия значимы при уровне p<0,001.
Рис. 2. Кривые Каплана–Мейера госпитальной летальности в стационаре.
Результаты унивариантного анализа выживаемости Кокса показали, что для пациентов, госпитализированных в период волны Альфа, мужской пол увеличивал риск госпитальной смерти в 1,5 раза, наличие АГ – в 1,6, СД – в 1,8, ХОБЛ – в 2,3, ИБС – в 3,4, ХСН – в 3,1 раза. Возраст госпитализируемых в период волны Альфа также являлся значимым фактором риска – увеличение возраста пациента на 1 год относительно среднего (59,5 года) повышало риск смерти в 1,06 раза. Возраст пациента являлся значимым предиктором риска госпитальной смертности и для пациентов в волну Дельта: увеличение возраста пациента на 1 год относительно среднего (62 года) повышало риск смерти в 1,07 раза. Предиктором, снижающим вероятность выживания для пациентов в волну Дельта, также являлось наличие ИБС с отношением рисков 1,8. Для пациентов, госпитализированных в волну Омикрон, достоверных факторов риска при p<0,05 не выявлено. При p<0,1 для пациентов с Омикрон низкий ИМТ значимо повышал вероятность госпитальной смерти.
Обсуждение
Агрессивный мутационный ландшафт SARS-CoV-2 связан с высокими уровнями аффинности к сайтам связывания клеточной мембраны (функциональным рецепторам), повышенными скоростями внутриклеточной репликации вируса, высокой передаваемостью/инфекционностью и, наконец, тяжелым фенотипом заболевания (повышенные уровни заболеваемости и смертности) в подгруппе инфицированных пациентов с определенными демографическими, клиническими и генетическими/эпигенетическими сигнатурами [8, 9]. В мировых исследованиях смертность в 2020–2022 гг. в разных странах мира составляла 2–5%, причем в Российской Федерации она одна из самых высоких [10].
В нашем исследовании показано различие клинико-демографических параметров госпитализированных пациентов при сравнении 3 вариантов вируса. Более того, выявлена значимая разница в уровне госпитальной смертности, причем максимальная смертность характерна для варианта Альфа (6%), меньшая – для варианта Дельта (5,7%), значительно меньшая – для варианта Омикрон (1,5%; p<0,001). Данный факт выявлен и в других публикациях, в которых отмечено снижение «агрессивности» последнего штамма [11]. Высокая смертность в начале пандемии при варианте Альфа могла быть связана и с отсутствием доказанных клинических стратегий и рекомендаций по лечению заболевания в начале пандемии, таких как антикоагулянтная терапии, эффективная и безопасная противовирусная терапия, использование глюкокортикоидов и биологической терапии [12]. Большая смертность в нашем исследовании, чем в популяции (2–5%), связана с анализом только госпитальной смертности, т.е. у изначально более тяжелых пациентов. Штамм Омикрон появился, когда человечество стояло на пороге достижения всемирного иммунитета с помощью глобальной вакцинации против SARS-CoV-2, а снижение летальности штамма может быть связано как с интенсивной мутацией вируса, так и с повсеместной вакцинацией [13, 14]. Нами отмечено значительное снижение срока госпитализации при штаммах Дельта [7 дней (5; 9)] и Омикрон [7 (5; 11)] по сравнению с вариантом Альфа [11 (9; 13); p<0,001], что связано, возможно, с увеличением опыта диагностики и лечения пациентов в специализированных стационарах.
Выявлены различия в факторах риска летальности между исследованными COVID-вариантами. В частности, характерен достоверно больший возраст пациентов с вариантом Альфа (p<0,001) по сравнению с остальными. Среди умерших для первых 2 штаммов больше характерен женский пол, тогда как в варианте Омикрон было больше мужчин. Такие кардиоваскулярные заболевания, как АГ, ИБС, ХСН, а также ХБП и СД являлись факторами риска летального исхода при вариантах Альфа и Дельта, но не при штамме Омикрон. Данные факторы риска в отношении смертности при COVID-19 подтверждены в целом ряде других исследований [12, 15–17]. Многие авторы считают, что появление варианта Омикрон в большей степени с «респираторным» фенотипом по сравнению с «кардиоваскулярным» фенотипом при вариантах Альфа и Дельта обеспечило резкое снижение смертности/летальности при инфицировании [11, 18]. Вероятно, уменьшение смертности от варианта Омикрон и влияния соматических факторов риска на смертность свидетельствует об ограничении роли самого COVID-19 и увеличении влияния на смертность уже основной патологии (респираторные, эндокринологические и сердечно-сосудистые заболевания).
Следует отметить, что, несмотря на резкое снижение уровней заболеваемости COVID-19, госпитализации и летальности, все изучаемые штаммы остаются в популяции, особенно в закрытых когортах, и могут заново вызывать эндемичные очаги, учитывая повсеместное снижение частоты/отказ от вакцинации против COVID-19. Соответственно, полученные результаты представляют интерес в условиях возможностей быстрой и несложной идентификации варианта вируса [4].
Заключение
Показано различие в уровне госпитальной летальности между вариантами COVID-19, причем наибольшая выявлена при варианте Альфа, несколько меньшая – при Дельта, значительно меньшая – при штамме Омикрон. Показаны различия среди факторов риска летального исхода между вариантами, в частности выявлено, что сопутствующие заболевания (АГ, ИБС, ХСН, СД, ХБП) являлись факторами риска летального исхода для вариантов Альфа и Дельта, но не для штамма Омикрон.
Ограничения исследования. Исследование явилось одноцентровым. Вирусологическая идентификация штаммов проводилась только у части госпитализированных больных. Критерии диагностики, схемы лечения и критерии госпитализации постоянно трансформировались в течение 2020–2022 гг. в соответствии с рекомендациями Минздрава России, что могло оказать влияние на летальность пациентов. В нашем исследовании мы также не анализировали воздействие вакцинации госпитализированных пациентов, начавшейся в 2020 г.
Раскрытие интересов. Авторы декларируют отсутствие явных и потенциальных конфликтов интересов, связанных с публикацией настоящей статьи.
Disclosure of interest. The authors declare that they have no competing interests.
Вклад авторов. Авторы декларируют соответствие своего авторства международным критериям ICMJE. Все авторы в равной степени участвовали в подготовке публикации: разработка концепции статьи, получение и анализ фактических данных, написание и редактирование текста статьи, проверка и утверждение текста статьи.
Authors’ contribution. The authors declare the compliance of their authorship according to the international ICMJE criteria. All authors made a substantial contribution to the conception of the work, acquisition, analysis, interpretation of data for the work, drafting and revising the work, final approval of the version to be published and agree to be accountable for all aspects of the work.
Информированное согласие на публикацию. Пациенты подписали форму добровольного информированного согласия на публикацию медицинской информации.
Consent for publication. Written consent was obtained from the patients for publication of relevant medical information and all of accompanying images within the manuscript
Соответствие принципам этики. Протокол исследования был одобрен локальным этическим комитетом БГМУ по клиническим дисциплинам (№9 от 17 декабря 2021 г.). Одобрение и процедуру проведения протокола получали по принципам Хельсинкской конвенции.
Ethics approval. The study was approved by the local ethics committee of Bashkir State Medical University in clinical disciplines (No. 9 dated December 17, 2021).
Источник финансирования. Исследование выполнено при поддержке гранта Российского научного фонда 22-18-20123.
Finding source. The study was supported by Russian Science Foundation's grant 22-18-20123.
About the authors
Diana F. Gareeva
Bashkir State Medical University
Email: d.f.gareeva@mail.ru
ORCID iD: 0000-0002-1874-8661
Scopus Author ID: 56700303400
ResearcherId: G-3941-2016
кандидат медицинских наук, доц. кафедры пропедевтики внутренних болезней
Russian Federation, UfaIrina A. Lakman
Ufa University of Science and Technology
Email: Lackmania@mail.ru
ORCID iD: 0000-0001-9876-9202
кандидат техн. наук, доцент, вед. научный сотрудник управления научных исследований и разработок
Russian Federation, UfaAlexander A. Agapitov
Ufa University of Science and Technology
Email: aleks6321@yandex.ru
ORCID iD: 0000-0002-3618-2657
laboratory researcher of Scientific Research and Development Department
Russian Federation, UfaLiana F. Sadikova
Ufa University of Science and Technology
Email: walsh.lea@gmail.com
ORCID iD: 0000-0001-9250-5548
laboratory researcher of Scientific Research and Development Department
Russian Federation, UfaParuir A. Davtian
Bashkir State Medical University
Email: davtyanparuir@gmail.com
ORCID iD: 0000-0002-5972-6418
postgraduate student at Propaedeutics of internal diseases department
Russian Federation, UfaValeriia L. Kayumova
Bashkir State Medical University
Email: al_val_leon@mail.ru
ORCID iD: 0009-0004-9006-6536
resident at Propaedeutics of internal diseases department
Russian Federation, UfaGuzel M. Nurtdinova
Bashkir State Medical University
Email: guzel-doc@mail.ru
ORCID iD: 0000-0002-1662-821X
MD, Phd, Assosiate professor at Propaedeutics of internal diseases department
Russian Federation, UfaElena A. Badykova
Bashkir State Medical University
Email: lnurova@mail.ru
ORCID iD: 0000-0002-8167-4271
MD, PhD, assistant at Propaedeutics of internal diseases department
Russian Federation, UfaMagomed S. Kurbanov
Bashkir State Medical University
Email: magomedkurbanov10@mail.ru
ORCID iD: 0009-0005-0788-5336
student of the Faculty of Medicine
Russian Federation, UfaIslam R. Idigov
Bashkir State Medical University
Email: nikitakorolev1004@gmail.com
ORCID iD: 0009-0000-4314-3704
student of the Faculty of Medicine
Russian Federation, UfaLukas Fiedler
Landesklinikum Wiener Neustadt
Email: flukas@me.com
ORCID iD: 0000-0003-2626-3098
MD, oberarzt, doctor of medicine, senior physician
Austria, Wiener NeustadtLukas-Jaroslaw Motloch
Clinic II for Internal Medicine, University Hospital Salzburg, Paracelsus Medical University; Department of Internal Medicine II, Salzkammergut Klinikum; Johannes Kepler University, Department of Cardiology, Kepler University Hospital, Medical Faculty
Email: Lukas.Motloch@ooeg.at
ORCID iD: 0000-0002-5829-6743
Dr med, MD., professor, Head of Department of Internal Medicine II, Salzkammergut Klinikum
Austria, Salzburg; Vöcklabruck; LinzАnna-Maria Dieplinger
Institute for Nursing Science and Practice, Paracelsus Medical University
Author for correspondence.
Email: AnnaMaria.Dieplinger@ooeg.at
ORCID iD: 0000-0002-4332-2347
MD, PhD, cooperator
Austria, SalzburgVenera M. Timiryanova
Ufa University of Science and Technology
Email: 79174073127@mail.ru
ORCID iD: 0000-0002-1004-0722
Leading researcher of Scientific Research and Development Department
Russian Federation, UfaNaufal Sh. Zagudullin
Bashkir State Medical University
Email: znaufal@mail.ru
ORCID iD: 0000-0003-2386-6707
Doctor of Medical Sciences, Professor, Phd, MD, Director of the Research Institute of Cardiology, Head of the Department of Propaedeutics of Internal Diseases
Russian Federation, UfaReferences
- The Johns Hopkins Coronavirus Resource Center. Available at: https://coronavirus.jhu.edu. Accessed: 02.08.2023.
- Burki T. Understanding variants of SARS-CoV-2. Lancet. 2021;397(10273):462. doi: 10.1016/S0140-6736(21)00298-1
- Winger A, Caspari T. The spike of concern – the novel variants of SARS-CoV-2. Viruses. 2021;13(6):1002. doi: 10.3390/v13061002
- Molina-Mora JA, Cordero-Laurent E, Calderón-Osorno M, et al. Metagenomic pipeline for identifying co-infections among distinct SARS-CoV-2 variants of concern: study cases from Alpha to Omicron. Sci Rep. 2022;12(1):9377. doi: 10.1038/s41598-022-13113-4
- Bazargan M, Elahi R, Esmaeilzadeh A. OMICRON: Virology, immunopathogenesis, and laboratory diagnosis. J Gene Med. 2022;24(7):e3435. doi: 10.1002/jgm.3435
- Бычинин М.В., Клыпа Т.В., Мандель И.А., и др. Сравнительная клинико-лабораторная характеристика пациентов реанимационного профиля первой и второй волн пандемии COVID-19. Анестезиология и реаниматология. 2022;4:57-65 [Bychinin MV, Klypa TV, Mandel IA, et al. Clinical and laboratory characteristics of intensive care patients of the first and second waves of the COVID-19 pandemic. Russian Journal of Anesthesiology and Reanimatology. 2022;4:57-65 (in Russian)]. doi: 10.17116/anaesthesiology202204157
- Haklai Z, Goldberger NF, Gordon E-S. Mortality during the first four waves of COVID-19 pandemic in Israel: March 2020 – October 2021. Isr J Health Policy Res. 2022;11(1):24. doi: 10.1186/s13584-022-00533-w
- V’kovski P, Kratzel A, Steiner S, et al. Coronavirus biology and replication: implications for SARS-CoV-2. Nat Rev Microbiol. 2021;19(3):155-70. doi: 10.1038/s41579-020-00468-6
- Marchi R, Sugita B, Centa A, et al. The role of microRNAs in modulating SARS-CoV-2 infection in human cells: a systematic review. Infect Genet Evol. 2021;91:104832-9. doi: 10.1016/j.meegid.2021.104832
- COVID-19 Excess Mortality Collaborators. Estimating excess mortality due to the COVID-19 pandemic: a systematic analysis of COVID-19-related mortality, 2020–21. Lancet. 2022;399(10334):1513-36. doi: 10.1016/S0140-6736(21)02796-3
- Lauring AS, Tenforde MW, Chappell JD, et al. Clinical severity of, and effectiveness of mRNA vaccines against, COVID-19 from omicron, delta, and alpha SARS-CoV-2 variants in the United States: prospective observational study. BMJ. 2022;376:e069761. doi: 10.1136/bmj-2021-069761
- Арутюнов Г.П., Тарловская Е.И., Арутюнов А.Г., и др. Анализ влияния коморбидной сердечно-сосудистой патологии на течение и исходы COVID-19 у госпитализированных пациентов в первую и вторую волну пандемии в Евразийском регионе. Кардиология. 2022;62(12):38-49 [Arutyunov GP, Tarlovskaya EI, Arutyunov AG, et al. Analysis of the impact of comorbid cardiovascular pathology on the course and outcomes of COVID-19 in hospitalized patients during the first and second waves of the pandemic in the Eurasian region. Kardiologiia. 2022;62(12):38-49 (in Russian)]. doi: 10.18087/cardio.2022.12.n2125
- Rahmani S, Rezaei N. Omicron (B.1.1.529) variant: Development, dissemination, and dominance. J Med Virol. 2021;94(5):1787-8. doi: 10.1002/jmv.27563
- Gu H, Krishnan P, Ng DYM, et al. Probable Transmission of SARS-CoV-2 Omicron Variant in Quarantine Hotel, Hong Kong, China, November 2021. Emerg Infect Dis. 2022;28(2):460-2. doi: 10.3201/eid2802.212422
- Zagidullin NS, Motloch LJ, Musin TI, et al. J-waves in acute COVID-19: A novel disease characteristic and predictor of mortality? PLoS ONE. 2021;16(10):e0257982. doi: 10.1371/journal.pone.0257982
- Лакман И.А., Мусин Т.И., Галиуллина А.Р., и др. Факторы риска перевода больных с COVID-19 на искусственную вентиляцию легких в ретроспективном нерандомизированном исследовании. Вестник Российской академии медицинских наук. 2022;77(1):33-42 [Lakman IA, Musin TI, Galiullina AR, et al. Risk Factors of Transfer to Mechanical Ventilation of COVID-19 Patients in a Retrospective Non-Randomized Study. Annals of the Russian Academy of Medical Sciences. 2022;77(1):33-42 (in Russian)]. doi: 10.15690/vramn1673
- Shi S, Qin M, Shen B, et al. Association of Cardiac Injury With Mortality in Hospitalized Patients With COVID-19 in Wuhan, China. JAMA Cardiol. 2020;5(7):802-10. doi: 10.1001/jamacardio.2020.0950
- El-Shabasy RM, Nayel MA, Taher MM, et al. Three waves changes, new variant strains, and vaccination effect against COVID-19 pandemic. Int J Biol Macromol. 2022;204:161-8. doi: 10.1016/j.ijbiomac.2022.01.118