A GENETIC ANALYSIS OF A H1N1 PANDEMIC INFLUENZA VIRUS IN THE COURSE OF THE EPIDEMIC


Cite item

Full Text

Abstract

Aim. To assess genetic variability of A H1N1 pan influenza virus (IV) in the course of the epidemic and to detect a set of human nucleotide polymorphisms responsible for a severe course of the disease. Material and methods. Extraction and purification ofviral genomic RNA from the nasopharyngeal smears and genomic human DNA from the leukocytic fraction of venous blood was made in 230 patients from Moscow, Moscow and Sverdlovsk Regions with severe acute respiratory virus infection (ARVI). A flu virus type was established in amplification reaction with on-line detection of the products with application of primers recommended by WHO. Genetic polymorphisms of A H1N1 pan IV and human genes were determined with minisequencing reaction followed by detection of the products of MALDI-time-of-flight mass-spectrometry. Nucleotide sequences of the complete genome were revealed for 15 isolates of A H1N1 pan IV. Results. A H1N1 IV was identified in 77 cases (46 were pandemic, 31 seasonal). Mutations causing genetically determined resistance to adamants (amantadin, rimantadin) were detected in all 46 samples of genomic RNA of A H1N1 pan IV. Mutation leading to oseltamivir (tamiflu) resistance was found in one sample. It is shown that a severe course of A H1N1 pan IV infection is associated with genotypes predisposing to development of thromboses, bronchopulmonary diseases and hypertention. Genetic tests for prognosis of a complicated course of the flu are proposed. The revealed full-genome sequences of the segments of genomic RNA of 15 A H1N1 pan influenza viruses are deposited in GenBank. Conclusion. We are the first in Russia to detect a mutant variant of A H1N1 pan IV resistant to oseltamivir. We describe a set of nucleotide polymorphisms which determine a complicated course of the flu in patients with identified A H1N1 pan IV.

Full Text

ВГ А H1N1 "пан" — вирус гриппа A H1N1 "пандемический" ОРДС — острый респираторный дистресс-синдром ОРВИ — острая респираторная вирусная инфекция ПЦР — полимеразная цепная реакция Первые сообщения о вспышке инфекции, вызванной новым вирусом, в дальнейшем идентифицированным как вирус гриппа A H1N1 "пандемический" (ВГА H1N1 "пан"), появились в апреле 2009 г. [1, 2]. Он представлял собой вариант сезонного вируса гриппа A H1N1 и характеризовался высокой контагиозностью. Это привело к объявлению пандемии вируса гриппа ВОЗ и Центром по контролю и профилактике заболеваний США в июне 2009 г. [3]. Механизм действия ВГ А H1N1 " пан" на организм человека аналогичен таковому при поражении другими штаммами вируса гриппа [4, 5]. Главным звеном в патогенезе является поражение сосудистой системы, приводящее к нарушениям микроциркуляции и застойному полнокровию внутренних органов. В свою очередь это ведет к развитию отека легочной ткани с множественными кровоизлияниями в альвеолы и интерстиций [6]. Отличительной особенностью развития инфекции стало формирование вирусной пневмонии и отека легких на 3—6-е сутки после появления первичной симптоматики [7]. Широко применяемые противовирусные препараты группы адамантов (амантадин и римантадин) оказались неэффективными против ВГ А НIN1 "пан" за счет накопления специфических мутаций в вирусном геноме. Согласно рекомендациям ВОЗ препаратами выбора для лечения ВГ А НIN1 "пан" являются осель-тамивир (тамифлю) и занамивир (реленза), устойчивость к которым в популяции еще не сформировалась. Целью настоящей работы явились оценка генетической изменчивости ВГ А НIN1 "пан" в условиях эпидемии и обнаружение набора нуклеотидных полиморфизмов человека, предопределяющих тяжелую форму течения заболевания. Контактная информация: Кострюкова Елена Сергеевна — канд. биол. наук, ст. науч. сотр. лаб. постгеномных исследований в биологии ФГУ НИИ ФХМ ФМБА России, тел. 8-499-246-44-38; e-mail: el-es@yandex.ru — 49 — Е. С. Кострюкова и соавт. Таблица 1 Праймеры и флюоресцентные зонды, рекомендованные ВОЗ, для выявления вирусов гриппа H1N1 типов «сезонный» и «пандемический» Название Последовательность 5'—3' Тип вируса InfA Forward gaccratcctgtcacctctgac «Сезонный» InfA Reverse agggcattytggacaaakcgtcta InfA Probe tgcagtcctcgctcactgggcacg — FAM SW InfA gcacggtcagcacttatyctrag «ПандемичеForward скии» SW InfA Reverse gtgrgctgggttttcatttggtc SW InfA cyactgcaagcccatacacacaagcaggca — Probe HEX В ходе исследования предложена оригинальная методика забора и транспортировки вирусного материала от пациентов, позволившая достичь высокой эффективности выделения геномной РНК вируса для последующей генетической характеристики. На основании реакций минисеквенирования с последующей детекцией продуктов МАЛДИ-времяпролетной масс-спектрометрией созданы системы быстрого обнаружения генетических детерминант устойчивости возбудителя к противовирусным препаратам. Аналогичный принцип использован для выявления генетической предрасположенности пациентов к развитию тромбозов, бронхолегочных заболеваний и гипертонических состояний. Материалы и методы Клинический материал от пациентов с тяжелыми формами острой респираторной вирусной инфекции (ОРВИ) поступал из медицинских центров Москвы, Московской и Свердловской областей. Назофарингеальные мазки брали одноразовыми синтетическими зондами ("Deltalab", Испания), которые сразу же замораживали в 1 мл 4 М раствора гуанидина тиоцианата ("Amresco", США). Образцы венозной крови брали в пробирки с ЭДТА, хранили и транспортировали при температуре 4°С. От пациентов, умерших от осложнений тяжело протекавшего ОРВИ, брали образцы легочной ткани, которые также сразу замораживали в 1 мл 4 М раствора гуанидина тиоцианата. Геномную РНК вируса гриппа выделяли с использованием микроколонок с сорбирующим фильтром (ООО "Техноклон", Россия) согласно рекомендации производителя. Геномную ДНК из лейкоцитарной фракции венозной крови пациентов выделяли с использованием набора "Wizard Genomic DNA Purification Kit" ("Promega", США) согласно инструкции производителя. Синтез кДНК вируса гриппа осуществляли с помощью РНК-зависимой ДНК-полимеразы "RevertAid Reverse Transcriptase" (200 ед/мкл) ("Fermentas", Литва) по рекомендуемому производителем протоколу с использованием праймера AGCAAAAGCAGG. Генетическое тестирование вируса гриппа. Разновидность вируса гриппа определяли с помощью полимеразной цепной реакции (ПЦР) с детекцией результатов в режиме реального времени. В качестве матрицы использовали кДНК вируса, амплификацию проводили с праймерами и зондами, рекомендованными ВОЗ (табл. 1), на приборе "IQ-5" ("BioRad", США) по рекомендованному протоколу [8]. Таблица 2 Последовательности олигонуклеотидов для определения устойчивости ВГ А НIN1 «пан» к противовирусным препаратам Сег мент Последовательность праймеров для ПЦР (5'—3') Мутация Последовательность праймеров для минисеквенирования (5’—3’), масса (Да) аминокислота нуклеотид NA acgttggatggcctcatacaagatcttcag ggagcattcctcatagt, 5185 acgttggatgggataacaggagcattcc H275Y CAC ^ tAC M2 agctccagtgctggtctgaaag S31N AGT ^ AaT tgcaagatcccaatgata, 5492 gactcaggcactccttccgtagaa L26F CTC ^ Ttc cagcgattcaagtgatcct, 5788 A30V/T GCA ^ aCA/GtA tgatcctctcgtcattgca, 5730 G34E GGG ^ GaG cacaatatcaggtgcaagatc, 6424 Амплификацию фрагментов вирусного генома, несущих маркеры устойчивости к противовирусным препаратам, проводили в мультиплексном формате с использованием праймеров, указанных в табл. 2. Полученные ампликоны анализировали на наличие мутаций, обусловливающих устойчивость к адамантам и осельтамивиру, в реакции минисеквенирования с последующей масс-спектрометрической детекцией по схеме, описанной ранее [9]. Последовательности праймеров и расчетные массы продуктов реакции приведены в табл. 2. Для полноразмерного геномного секвенирования сегменты вирусного генома амплифицировали в два этапа с использованием универсальных праймеров agtcaggcagcaaaagcagg и agaaagggagtagaaacaagg на первом и парами специфических праймеров, рекомендованных ВОЗ [10], на втором. Продукты реакции разделяли горизонтальным электрофорезом в 2% агарозном геле с окрашиванием бромистым этидием. Полосы, соответствующие целевым ампликонам, вырезали из геля, и элюировали ДНК с помощью центрифугирования при 6000 об./мин 5 мин с использованием стекловолоконных фильтров. Нуклеотидную последовательность ампликонов определяли с помощью набора "Big Dye Terminator v. 3.1 Cycle Sequencing" ("Applied Biosystem", США) согласно инструкции производителя с использованием праймеров M13Forvard и M13Reverse. Продукты реакции анализировали на автоматическом секвенаторе "ABI Prism Genetic Analyzer 3730XL" ("Applied Biosystem", США, "Hitachi", Япония). Полученные нуклеотидные последовательности выравнивали против референсной и депонировали в базе данных GenBank (www.ncbi.nlm.nih.gov). Генетическое исследование у пациентов с тяжелыми формами ОРВИ. Генотипирование отобранной группы больных для оценки предрасположенности к тяжелому течению респираторного заболевания осуществляли на основании регистрации однонуклеотидных полиморфизмов по схеме, описанной ранее [9]. Праймерные системы приведены в табл. 3. Результаты В ходе исследования был сформирован лабораторный банк клинических образцов от больных тяжелыми формами ОРВИ — назальные смывы либо мазок зева (n = 225), венозная кровь (n = 225), аутопсийный материал (n = 5). Образцы сопровождали письмами с указанием лечебного учреждения, номера истории болезни, фамилии, имени и отчества, возраста, пола пациента. Клинический диагноз указывали исходя из данных физического исследования и результатов лабораторно-инструментального исследования. У всех умерших больных при тяжелом течении пандемического гриппа A/H1N1/2009 выявлены массивная двусторонняя пневмония, синдром острого поражения легких или острый респираторный дистресс-синдром (ОРДС), быстро прогрессирующая острая дыхательная недостаточность, приводящая к значительному снижению уровня насыщения артериальной крови кислородом. Генетический материал, эстрагированный из 230 назофарингеальных мазков и аутопсий, подвергали тестированию, позволяющему обнаруживать вирус гриппа А H1N1 и одновременно разграничивать его по типам "сезонный" и "пандемический". Штамм вируса гриппа A H1N1 удалось идентифицировать в 77 (34%) случаях. При этом ВГ А НIN1 "пан" выявлен в 46 (20%) случаях, штамм вируса гриппа А H1N1 "сезонный" — в 31 (14%). Резистентность ВГ А НIN1 "пан" к противовирусным препаратам оценивали на основании обнаружения мутации H275Y в сегменте 6 (NA), определяющей его устойчивость к осельтамивиру [11—13], а также мутаций L26F, S31N, A30V., A30T, G34E в сегменте 7 (М2), ассоциированных с устойчивостью к аманта-дину и римантадину [14—16]. Мутация S31N в сегменте 7 (M2) (рис. 1) обнаружена во всех 46 образцах, в остальных исследованных кодонах сегмента 7 (M2) мутаций не найдено. Устойчивый к осельтамивиру штамм с мутацией H275Y сегмента 6 (NA) (рис. 2) выявлен у одного пациента. — 50 — Генетический анализ вируса гриппа A НIN1 "пандемический" в условиях эпидемии Последовательность олигонуклеотидов для Таблица 3 выявления генетических полиморфизмов, предопределяющих тяжелое течение вирусной инфекции Ген Последовательность праймеров для ПЦР (5 ' 3') Мутация Последовательность праймеров для Смесь Масса продуктов реакции минисеквенирования (Да) аминокислота нуклеотид минисеквенирования (5'—3'), масса (Да) дНТФ/ддНТФ норма мутация ACE gccctgcaggtgtctgcagcatgt ggatggctctccccgc cttgtctc 16 интрон 250nHDEL/INS IVS16 + 2123 cctcagcctcccaagtag, 5301 ddC 5574-DD 5678-II AGT ggctgtgacaggatggaagac caggtatgtccgcaggctg M235T T1311C ctgtccacactggctccc, 5372 ddA, dG, ddT 5669-TT 5989-CC NOS ccacagctctgcattcagca atttaggaggcaaccctggac E298D T7965G tgcaggccccagatga, 4892 ddG, dT, ddC 5205-GG 5469-TT ADRB2 agtgcgctcacctgccaga aactcgcaccagaagttgcca G16R G285A ggtccggcgcatggcttc, 5508 ddA, dC, ddT 5781-GG 6109-AA MMP1 tgccacttagatgaggaaattgt atggattcctgttttctttctgc промотор IVS1-1607delG gatttgagataagtcatatc, 6155 ddC, dT 6428-GG 7350-del SFTPC ctcccgtgcccaaccta gctggcagccaatgagg N138T A1854C cccagtcttgaggctctca, 5740 ddC, ddT, dA 6341-AA 6013-CC SFTPC сacagcccctctttactgatga tggatgaccccgcttca N186S A2334G gggcatggccgtga, 4345 ddC, ddA, dG 4642-AA 4947-GG F2 gaagaagtggatacagaaggtca agctgcccatgaatagcact E622K G20210A cactgggagcattgaggct, 5869 ddC, ddG, dT 6142-GG 6486-AA FGB_b agctattcagcacaaaaaaaggg cacaaggcaaccactaaaatcg промотор IVS1-455G > A ttctatttcaaaaggggc, 5514 ddC, dT, ddA 5787-GG 6115-AA Примечание. ACE — ген, кодирующий ангиотензинпревращающий фермент; AGT — ген, кодирующий ангиотензиноген; NOS — ген, кодирующий синтазу оксида азота; ADRB2 — ген, кодирующий адренорецептор ß2; MMP1 — ген, кодирующий матриксную металлопротеиназу-1; SFTPC — ген, кодирующий сурфактантный белок С; F2 — ген, кодирующий коагуляционный фактор F2; FGB_b — ген, кодирующий фибриноген. Исходя из накопленных знаний о механизмах взаимодействия ВГ А НIN1 "пан" и организма человека мы провели совокупный анализ полиморфизмов в генах человека, относящихся к системам регуляции свертывания крови, сурфактантного звена и сосудистого тонуса (табл. 3), продукты которых играют ведущую роль в патогенезе ОРДС и могут предопределять тяжелое течение вирусной инфекции. Из 46 образцов от пациентов с идентифицированным штаммом ВГ А НIN1 "пан" были отобраны 25 от пациентов со среднетяжелыми и тяжелыми формами гриппа; 14 из этих пациентов находились на лечении в ИКБ № 1 Москвы. Среди наблюдаемых больных было 11 женщин, 2 мужчин в возрасте от 19 до 55 лет (средний 30,1 ± 2,2 года) и один новорожденный мальчик, умерший на 2-е сутки после рождения. Среди женщин было 8 беременных на разных сроках беременности (I триместр — одна, II триместр — 4, III триместр — 3). У всех пациентов диагноз гриппа был подтвержден обнаружением РНК вируса гриппа А H1/N1 в носоглоточном смыве методом ПЦР, совместимой с обратной транскрипцией, в режиме реального времени. У 9 больных заболевание имело среднетяжелое течение, из них у 6 сопровождалось развитием диффузного бронхита, у 2 — очагово-сливной пневмонии без развития выраженной дыхательной недостаточности, у 2 пациенток выявлены острый катаральный отит и острый гнойный двусторонний верхнечелюстной синусит. Все случаи среднетяжелого течения гриппа закончились выздоровлением. Тяжелое течение гриппа было диагностировано у 5 пациентов (3 женщины, один мужчина, один ребенок); у всех наступил летальный исход. У 3 (60%) из 5 больных с тяжелым течением гриппа наблюдалось выраженное нарушение жирового обмена (ожирение III степени), у 2 — коронарокардиосклероз, ИБС, у 1 пациентки — гиРис. 1. Пример масс-спектра мультиплексной реакции минисеквенирования. а — пики соответствуют массам продуктов минисеквенирования для кодонов 26, 31, 30, 34 сегмента 7 (М2) и кодона 275 сегмента 6 (NA). Выявлены следующие генотипы; L26, SN31 (мутантный), А30, G34 в сегменте 7 (М2) и Н275 в сегменте 6 (NA); б — на приведенном масс-спектре отрицательного контроля все пики соответствуют массам зондов, внесенных в реакцию. — 51 — Е. С. Кострюкова и соавт. Рис 2. Пример масс-спектров типирования мутации H275Y в сегменте 6 (NA) в одноплексном формате. а — отрицательный контроль; б — образец, содержащий штамм без мутации; в — образец со смесью мутантного и дикого штаммов. пертоническая болезнь, у 1 больного — хроническая аневризма верхушки левого желудочка, слипчивый перикардит, состояние после аортокоронарного шунтирования, у 3 — хронический пиелонефрит, у 1 — хронический гепатит В, у 1 — сахарный диабет, у одного — пневмосклероз, эмфизема легких. Заболевание гриппом у этих больных сопровождалось развитием массивной двусторонней пневмонии и интерстициального и альвеолярного отека легких, быстро прогрессирующей острой дыхательной недостаточностью, что требовало проведения респираторной поддержки (всем больным этой группы проводилась искусственная вентиляция легких), у 4 из 5 пациентов с тяжелым течением гриппа наблюдался выраженный геморрагический синдром. Среди умерших были одна беременная (смерть наступила после оперативного родоразрешения при антенатально погибшем плоде на 27-й неделе беременности), а также новорожденный мальчик, родившийся глубоко недоношенным при сроке беременности 28 нед путем операции кесарева сечения от матери, болевшей пандемическим гриппом A/H1N1/2009. Ребенок при рождении имел массу 1500 г, длину 38 см, оценку по шкале Ап-гар 2—4 балла, у него оказалось внутриутробное инфицироваТаблица 4 Распределение пациентов согласно обнаружению мутантных аллелей в группах генов, ответственных за формирование бронхолегочной патологии (MMP1, STFPQ, тромбофилии (F2, FGB) и вазоконстрикции (NOS, ADRB2, AGT, ACE) Число пациентов с выявленными мутантными аллелями Бронхолегочная патология + гипертензия Бронхолегочная патология + тромбофилия гипертония + тромбо-филия Только в 2 профилях В 3 профилях 12 (12/25; 48 %) (2/5; 40%)* 0 13 (13/25; 52 %) (3/5; 60 %)* 0 Примечание. * — пациенты с летальным исходом. ние вирусом пандемического гриппа A/H1N1/2009, сопровождавшееся развитием бронхопневмонии. При обследовании пациентов для выявления предрасположенности к нарушениям в системе регуляции сосудистого тонуса, обусловленных мутациями в генах NOS, ADRB2, AGT и ACE [17—19], в образцах ДНК 14 из 25 пациентов обнаружены как минимум три полиморфизма, и лишь в единственном случае отмечен полиморфизм только в одном гене. Среди умерших у 3 также выявлено наличие сочетанных полиморфизмов генов, приводящих к нарушениям в системе регуляции сосудистого тонуса. Аналогично у 13 из 25 пациентов обнаружены полиморфизмы генов, кодирующих антикоагуляци-онный фактор F2 и фибриноген, предрасполагающие к развитию тромбофилии [20—22]. При этом у 3 из 5 умерших пациентов также обнаружены указанные полиморфизмы. Кроме того, у всех 25 пациентов имелись полиморфизмы генов, кодирующих сурфактантный белок C и матриксную металлопротеиназу-1, ассоциированные с развитием бронхолегочной патологии [23, 24]. При этом у 19 из 25 пациентов одновременно выявлены мутантные аллели по всем трем локусам. Примечательно, что в ходе генетического тестирования нам удалось выявить группу из 12 пациентов, включающую 3 больных с летальным исходом, у которых обнаружены полиморфизмы одновременно в 8 из 9 протестированных генов. При исследовании не выявлено пациентов с мутантным аллелем только в одном из 3 анализируемых профилях (табл. 4). Для 10 образцов ВГ А НIN1 "пан", полученных от пациентов из Москвы и Московской области с тяжелым течением заболевания, либо из аутопсийного материала, а также для 5 образцов от пациентов из Свердловской области были определены полноразмерные нуклеотидные последовательности 8 сегментов вирусного генома, в дальнейшем депонированные в GenBank (табл. 5). Обсуждение Выявление ВГ А НIN1 "пан" лишь в 46 случаях из 230, проанализированных в данной работе, подтверждает, что постановка дифференциального диагноза "пандемический грипп" может быть осуществлена только на основании генотипирования Таблица 5 Перечень геномных последовательностей ВГ А НIN1 "пан", депонированных в GenBank Изолят Место выделения Номера последовательностей (сегменты 1—8) (A/Russia/149/2009(H1N1)) Москва CY053413—CY053420 (A/Russia/165/2009(H1N1)) Свердловская область CY053624—CY053631 (A/Russia/14/2009(H1N1)) Москва CY053678—CY053685 (A/Russia/191/2009(H1N1)) Москва CY053686—CY053693 (A/Russia/74/2009(H1N1)) Москва CY053725—CY053732 (A/Russia/178/2009(H1N1)) Свердловская область CY053733—CY053740 (A/Russia/190/2009(H1N1)) Свердловская область CY053741—CY053748 (A/Russia/200/2009(H1N1)) Москва CY053749—CY053756 (A/Russia/4/2009(H1N1)) Москва CY054627—CY054634 (A/Russia/12/2009(H1N1)) Москва CY054635—CY054642 (A/Russia/19/2009(H1N1)) Москва CY054643—CY054650 (A/Russia/61/2009(H1N1)) Москва CY054651—CY054658 (A/Russia/100/2009(H1N1)) Москва CY054659—CY054666 (A/Russia/171/2009(H1N1)) Свердловская область CY054667—CY054674 (A/Russia/180/2009(H1N1)) Свердловская область CY054675—CY054682 — 52 — Генетический анализ вируса гриппа A НIN1 "пандемический" в условиях эпидемии IIIIIIIIIIIIIIII.......ІІІІІІІІ AATGAATGCCCCTAATTATTACTATG A G G А А 260 265 270 275 280 285 290 J_I_I_I_I_I_L Рис. 3. Фрагмент электрофореграммы последовательности сегмента 6 (NA) вируса A/Russia/61/2009(H1N1). Стрелкой указаны пики, соответствующие нуклеотидам C и T в положении 823. возбудителя. Причем тестирование должно осуществляться на ранних стадиях болезни, поскольку для данной формы вирусной инфекции характерны бурное течение и высокий риск развития осложнений, в том числе летальных, в первые несколько дней после появления симптоматики. Разработанная система быстрого обнаружения генетических детерминант резистентности ВГ А НIN1 "пан" к противовирусным препаратам подтвердила абсолютную устойчивость данного возбудителя к препаратам группы адамантов. Полученные с использованием описанного подхода данные были полностью подтверждены для 10 образцов, для которых определены полноразмерные последовательности сегментов вирусного генома. Выявление мутации H275Y гена нейраминидазы (NA) лишь в одном образце из 46 свидетельствует о низком риске наличия резистентности к осельтамивиру в российской популяции вируса. При этом у данного пациента вируса выявлены одновременно 2 генотипа, что выражается в появлении характерных пиков на масс-спектре (см. рис. 2, в) и подтверждается формированием в положении 823 п. н. сегмента 6 (NA) вируса A/Russia/61/2009 (H1N1) (CY054656) 2 пиков, соответствующих нуклеотидам Т и С, на электрофоре-грамме (рис. 3). Одновременное присутствие нормального и мутантного генотипов может свидетельствовать о повторном заражении пациента, о возникновении мутации вируса de novo или об исходном инфицировании двумя штаммами вируса. Исход любого инфекционного заболевания зависит от совокупности факторов, определяемых как индивидуальными свойствами инфекционного агента (вирулентность, контагиозность, устойчивость к антибактериальным агентам, иммуногенность), так и индивидуальными особенностями пациента, среди которых генетическая предрасположенность может быть легко определена и интерпретирована благодаря развитию технологий анализа нуклеиновых кислот. С учетом высокого риска развития ОРДС больным с идентифицированным ВГ А НIN1 "пан" было проведено геноти-пирование для оценки предрасположенности к тяжелому течению респираторного заболевания. Мы отдаем себе отчет, что для получения достоверных выводов необходимо проведение крупных эпидемиологических исследований. Однако обнаруженные нами закономерности даже на ограниченной выборке пациентов с тяжелыми формами гриппа, включающей 5 случаев с летальным исходом, дают основание полагать, что выявление генотипов, ассоциированных с нарушениями процессов синтеза сурфактанта, регуляции вазоконстрикции и тромбообразования, свидетельствует о предрасположенности к развитию тяжелых форм течения заболевания. Развитие гриппа, как и многих других острых респираторных инфекций, создает характерную патогенетическую ситуацию, ког да на основные системы пациента добавляется нагрузка, при которой выявляются скрытые генетические дефекты, компенсированные в условиях обычной жизнедеятельности. В ходе данного исследования нам не удалось учесть все факторы, способные влиять на тяжесть гриппозной инфекции. Остается открытым вопрос о вкладе в развитие инфекции сапрофитной микрофлоры дыхательного тракта, хотя существует мнение, что именно в случае ВГ А НIN1 "пан" этот вклад незначителен [25]. Кроме того, остается открытым вопрос о влиянии времени первого приема ингибиторов нейраминидазы и других вспомогательных терапевтических средств на тяжесть течения заболевания. Однако уже сейчас можно констатировать, что проведение своевременной диагностики и типирования вируса с одновременной оценкой генетического статуса пациента может существенно увеличить эффективность лечения тяжелых форм гриппа.
×

About the authors

E S Kostryukova

Research Institute of Physicochemical Medicine

Email: el-es@yandex.ru

N B Zakharzhevskaya

Research Institute of Physicochemical Medicine

P A Kostin

Research Institute of Physicochemical Medicine

E N Ilyina

Research Institute of Physicochemical Medicine

A K Larin

Research Institute of Physicochemical Medicine

O G Gribanov

Research Institute of Physicochemical Medicine

O V Selezneva

Research Institute of Physicochemical Medicine

E A Prikhodko

Research Institute of Physicochemical Medicine

T A Akopian

Research Institute of Physicochemical Medicine

E V Generozov

Research Institute of Physicochemical Medicine

V N Lazarev

Research Institute of Physicochemical Medicine; Institute of Bioorganic Chemistry of the Russian Academy of Sciences

S A Levitsky

Research Institute of Physicochemical Medicine; Institute of Bioorganic Chemistry of the Russian Academy of Sciences

I G Kondratov

Research Institute of Physicochemical Medicine

D G Alekseev

Research Institute of Physicochemical Medicine

N A Bazaleev

Research Institute of Physicochemical Medicine

E A Klimova

Moscow State Medical Stomatological University

M R Esaulova

Moscow State Medical Stomatological University

N D Yuschuk

Moscow State Medical Stomatological University

V M Govorun

Research Institute of Physicochemical Medicine; Institute of Bioorganic Chemistry of the Russian Academy of Sciences; Russian Research Center "Kurchatov Institute"

V I Sergienko

Research Institute of Physicochemical Medicine

References

  1. "Transcript of virtual press conference with Dr Keiji Fukuda, Assistant Director-General ad Interim for Health Security and Environment, World Health Organization". World Health Organization. 2009-07-07. http://www.who.int/mediacentre/Pandemic_h1n1_presstranscript_2009_07_07.pdf
  2. "Interim Novel Influenza A (H1N1) Guidance for Cruise Ships". Centers for Disease Control and Prevention. 2009-08-05. http://www.cdc.gov/h1n1flu/guidance/cruiseships.htm
  3. Chan, Dr. Margaret "World now at the start of 2009 influenza pandemic". World Health Organization. 2009-06-11. http://www.who.int/mediacentre/news/statements/2009/h1n1_pandemic_ phase6_20090611
  4. "CDC Briefing on Investigation of Human Cases of H1N1 Flu". Centers for Disease Control and Prevention. 2009-07-24. http://www.webcitation.org/5jeG7e0IC
  5. "Interim Guidance for 2009 H1N1 Flu (Swine Flu): Taking Care of a Sick Person in Your Home". Centers for Disease Control and Prevention. 2009-08-05. http://www.cdc.gov/h1n1flu/guidance_homecare.htm
  6. Mauad T., Hajjar L. A., Callegari G. D. et al. Am. J. Respir. Crit. Care Med. 2010; 181 (1): 72—79.
  7. Clinical features of severe cases of pandemic influenza. World Health Organization. 2009-10-16 http://www.who.int/csr/disease/swineflu/notes/h1n1_clinical_features_20091016/en/
  8. CDC protocol of realtime RTPCR for influenza A (H1N1). World Health Organization. http://www.who.int/csr/resources/publications/swineflu/CDCRealtimeRTPCR_SwineH1Assay-2009_20090430.pdf
  9. Ilina E. N., Malakhova M. V., Generozov E. V. et al. Matrix-assisted laser desorption ionization-time of flight (mass spectrometry) for hepatitis C virus genotyping. J. Clin. Microbiol. 2005; 43 (6): 2810-2815.
  10. Sequencing primers and protocol. World Health Organization. http://www.who.int/csr/resources/publications/swineflu/Genome-Primers_20090512.pdf
  11. Le Q. M., Wertheim H. F., Tran N. D. et al. A community cluster of oseltamivir-resistant cases of 2009 H1N1 influenza. N. Engl. J. Med. 2010; 362 (1): 86—87.
  12. Gulland A. First cases of spread of oseltamivir resistant swine flu between patients are reported in Wales. Br. Med. J. 2009; 339: b4975.
  13. Eshaghi A., Bolotin S., Burton L. et al. Genetic microhetero-geneity of emerging H275Y influenza virus A (H1N1) in Toronto, Ontario, Canada from the 2007-2008 respiratory seasons. J. of Clin. Virol. 2009; 45: 142—145.
  14. Holsinger L.J., Nichani D., Pinto L.H. et al. Influenza A virus M2 ion channel protein: a structure-function analysis. J. Virol. 1994; 68 (3): 1551—1563.
  15. Pinto L. H., Holsinger L. J., Lamb R. A. Influenza virus M2 protein has ion channel activity. Cell 1992; 69 (3): 517—528.
  16. Pinto L. H., Lamb R. A. Controlling influenza virus replication by inhibiting its proton channel. Mol. Biosyst. 2007; 3 (1): 18—23.
  17. Wang W. Y. S., Glenn C. L., Zhang W. et al. Exclusion of angiotensinogen gene in molecular basis of human hypertension: sibpair linkage and association analyses in Australian Anglo-Caucasians. Am. J. Med. Genet. 1999; 87: 53—60.
  18. Kobashi G., Yamada H., Ohta K. et al. Endothelial nitric oxide synthase gene (nOS3) variant and hypertension in pregnancy. Am. J. Med. Genet. 2001; 103: 241—244.
  19. Contopoulos-Ioannidis D. G., Manoli E. N., Ioannidis J.P.A. Metaanalysis of the association of beta-2-adrenergic receptor polymorphisms with asthma phenotypes. J. Allergy Clin. Immun. 2005; 115: 963—972.
  20. Lahti M., Marttila R., Hallman M. Surfactant protein C gene variation in the Finnish population-association with perinatal respiratory disease. Europ. J. Hum. Genet. 2004; 12: 312—320.
  21. Nogee L. M., Dunbar A. E., Wert S. et al. Mutations in the surfactant protein C gene associated with interstitial lung disease. N. Engl. J. Med. 2001; 344: 573—579.
  22. Joos L., He J.-Q., Shepherdson M. B. et al. The role of matrix metalloproteinase polymorphisms in the rate of decline in lung function. Hum. Mol. Genet. 2002; 11: 569—576.
  23. Franco R. F., Trip M. D., ten Cate H. et al. The 20210G-A mutation in the 3-prime-untranslated region of the prothrombin gene and the risk for arterial thrombotic disease. Br. J. Haemat. 1999; 104: 50—54.
  24. Tybjaerg-Hansen A., Agerholm-Larsen B., Humphries S. E. et al. A common mutation (G (-455)-to-A) in the beta-fibrinogen promoter is an independent predictor of plasma fibrinogen, but not of ischemic heart disease: a study of 9,127 individuals based on the Copenhagen City Heart Study. J. Clin. Invest. 1997; 99: 3034—3039.
  25. Gómez-Gómez A., Magaña-Aquino M., Garcia-Sepúlveda C. A. Severe pneumonia associated with Pandemic (H1N1) 2009 Outbreak, San Luis Potosi, Mexico. Emerg. Infect. Dis. 2010; 16: 27—34.

Supplementary files

Supplementary Files
Action
1. JATS XML

Copyright (c) 2012 Consilium Medicum

Creative Commons License
This work is licensed under a Creative Commons Attribution-NonCommercial-ShareAlike 4.0 International License.
 

Address of the Editorial Office:

  • Alabyan Street, 13/1, Moscow, 127055, Russian Federation

Correspondence address:

  • Alabyan Street, 13/1, Moscow, 127055, Russian Federation

Managing Editor:

  • Tel.: +7 (926) 905-41-26
  • E-mail: e.gorbacheva@ter-arkhiv.ru

 

© 2018-2021 "Consilium Medicum" Publishing house


This website uses cookies

You consent to our cookies if you continue to use our website.

About Cookies