Мақаланы E-mail арқылы жіберу Применение данных белковой кристаллографии и машинного обучения для разработки пептидной вакцины против африканской чумы свиней
- Авторлар: Ивановский А.1, Колесников И.2, Кордонская Ю.2,1, Ермаков А.2, Марченкова М.2,1, Тимофеев В.2,1, Писаревский Ю.2,1, Дьякова Ю.2, Ковальчук М.2
-
Мекемелер:
- Институт кристаллографии им. А.В. Шубникова ФНИЦ “Кристаллография и фотоника РАН
- Национальный исследовательский центр “Курчатовский институт”
- Шығарылым: Том 68, № 6 (2023)
- Беттер: 979-982
- Бөлім: КРИСТАЛЛОГРАФИЯ В БИОЛОГИИ И МЕДИЦИНЕ
- URL: https://ter-arkhiv.ru/0023-4761/article/view/673321
- DOI: https://doi.org/10.31857/S0023476123600805
- EDN: https://elibrary.ru/YEINQY
- ID: 673321
Дәйексөз келтіру
Ашық рұқсат
Рұқсат берілді
Тек жазылушылар үшін
Аннотация
Проанализирован геном африканской чумы свиней и выявлен белок, способный служить иммуногеном. Для водорастворимого фрагмента данного белка методом молекулярной динамики показано, что он стабилен в водно-солевом растворе. Иммуномоделирование показало, что данный фрагмент вызывает клеточный ответ, следовательно, может быть использован в качестве прототипа вакцины.
Авторлар туралы
А. Ивановский
Институт кристаллографии им. А.В. Шубникова ФНИЦ “Кристаллография и фотоника РАН
Хат алмасуға жауапты Автор.
Email: a.1wanowskiy@gmail.com
Россия, Москва
И. Колесников
Национальный исследовательский центр “Курчатовский институт”
Email: a.1wanowskiy@gmail.com
Россия, Москва
Ю. Кордонская
Национальный исследовательский центр “Курчатовский институт”; Институт кристаллографии им. А.В. Шубникова ФНИЦ “Кристаллография и фотоника РАН
Email: a.1wanowskiy@gmail.com
Россия, Москва; Россия, Москва
А. Ермаков
Национальный исследовательский центр “Курчатовский институт”
Email: a.1wanowskiy@gmail.com
Россия, Москва
М. Марченкова
Национальный исследовательский центр “Курчатовский институт”; Институт кристаллографии им. А.В. Шубникова ФНИЦ “Кристаллография и фотоника РАН
Email: a.1wanowskiy@gmail.com
Россия, Москва; Россия, Москва
В. Тимофеев
Национальный исследовательский центр “Курчатовский институт”; Институт кристаллографии им. А.В. Шубникова ФНИЦ “Кристаллография и фотоника РАН
Email: a.1wanowskiy@gmail.com
Россия, Москва; Россия, Москва
Ю. Писаревский
Национальный исследовательский центр “Курчатовский институт”; Институт кристаллографии им. А.В. Шубникова ФНИЦ “Кристаллография и фотоника РАН
Email: a.1wanowskiy@gmail.com
Россия, Москва; Россия, Москва
Ю. Дьякова
Национальный исследовательский центр “Курчатовский институт”
Email: a.1wanowskiy@gmail.com
Россия, Москва
М. Ковальчук
Национальный исследовательский центр “Курчатовский институт”
Email: a.1wanowskiy@gmail.com
Россия, Москва
Әдебиет тізімі
- Rodríguez J.M., Yáñez R.J., Almazán F. et al. // J. Virology. 1993. V. 67 (9). P. 5312.
- Mettenleiter T.C., Sobrino F. // Animal Viruses: Molecular Biology. 2008. V. 14. P. 5. https://doi.org/10.3201/eid1405.080077
- Anderson E.C., Hutchings G.H., Mukarati N., Wilkinson P.J. // Veterinary Microbiology. 1998. V. 62 (1). P. 1. https://doi.org/10.1016/S0378-1135(98)00187-4
- Khomenko S., Beltrán-Alcrudo D., Rozstalnyy A. et al. // Empress Watch. 2013. V. 28. P. 1
- Mazur-Panasiuk N., Woźniakowski G., Niemczuk K. // Sci Rep. 2019. V. 9. P. 4556. https://doi.org/10.1038/s41598-018-36823-0
- Colson P., De Lamballerie X., Yutin N. et al. // Arch Virol. 2013. V. 158. P. 2517. https://doi.org/10.1007/s00705-013-1768-6
- Dixon L.K., Chapman D.A., Netherton C.L., Upton C. // Virus Res. 2013. V. 173 (1). P. 3.
- Netherton C.L., Wileman T.E. // Virus Res. 2013. V. 173 (1). P. 76. https://doi.org/10.1016/j.virusres.2012.12.014
- Gaudreault N.N., Madden D.W., Wilson W.C. et al. // Front. Vet. Sci. 2020. V. 7. P. 215. https://doi.org/10.3389/fvets.2020.00215
- Колесников И.А., Тимофеев В.И., Николенко М.В. и др. // Кристаллография. 2023. Т. 68. № 6. С. 971. https://doi.org/10.31857/S0023476123600179
- https://pymol.org/2/
- Abraham M.J., Murtola T., Schulz R. et al. // SoftwareX. 2015. V. 1. P. 19. https://doi.org/10.1016/j.softx.2015.06.001
- Lindorff-Larsen K., Piana S., Palmo K. et al. // Proteins. 2010. V. 78. P. 1950. https://doi.org/10.1002/prot.22711
- Berendsen H.J. C., Postma J.P. M., van Gunsteren W.F. et al. // J. Chem. Phys. 1984. V. 81. P. 3684. https://doi.org/10.1063/1.448118
- Parrinello M., Rahman A. // J. Chem. Phys. 1982. V. 76. P. 2662. https://doi.org/10.1063/1.443248
- Hess B., Bekker H., Herman J.C. et al. // J. Comput. Chem. 1997. V. 18. P. 1463. https://doi.org/10.1002/(SICI)1096-987X(199709)18: 12%3C1463::AID-JCC4%3E3.0.CO;2-H
- Darden T., York D., Pedersen L. // J. Chem. Phys. 1993. V. 98 (12). P. 10089. https://doi.org/10.1063/1.464397
- https://kraken.iac.rm.cnr.it/C-IMMSIM/index.php
- Luckheeram R.V., Zhou R., Verma A.D., Xia B. // Clin. Dev. Immunol. 2012. https://doi.org/10.1155/2012/925135
- Rapin N., Lund O., Bernaschi M., Castiglione F. // PubMed. 2010. https://doi.org/10.1371/journal.pone.0009862
- Carvalho L., Sano Gi., Hafalla J. et al. // Nat Med. 2002. V. 8. P. 166. https://doi.org/10.1038/nm0202-166
- Abass O.A., Timofeev V.I., Sarkar B et al. // J. Biomol. Struct. Dynamics. 2021. V. 40 (16). P. 7283. https://doi.org/10.1080/07391102.2021.1896387
