Отправить статью по E-mail Разработка и апробация тест-системы для выявления РНК-вируса, вызывающего тяжелый острый респираторный синдром
- Авторы: Шипулин ГА1,2, Яцышина СБ1,2, Чуланов ВП1,2, Маркелов МЮ1,2, Шипулина ОЮ1,2, Подколзин АТ1,2, Астахова ТС1,2, Шишова A1,2, Wuchun Cao -3, Liu Wei -3, Fan Baochang -3
-
Учреждения:
- ГУ ЦНИИ эпидемиологии Минздрава РФ
- Научно-производственная лаборатория Федерального научно-методического центра СПИД
- Институт микробиологии и эпидемиологии Военно-медицинской академии Министерства обороны Китая
- Выпуск: Том 79, № 4 (2004)
- Страницы: 25-30
- Раздел: Передовая статья
- Статья получена: 09.04.2020
- Статья опубликована: 15.04.2004
- URL: https://ter-arkhiv.ru/0040-3660/article/view/29785
- ID: 29785
Цитировать
Полный текст
Аннотация
Результаты. Специфичность тест-системы, определенная с использованием штаммов коронавирусов животных и гетерологичных штаммов вирусов и бактерий, вызывающих острые респираторные и кишечные инфекции, составила 100%. Чувствительность тест-системы во всех рекомендованных видах клинического материала составила 2,2- Iff геномных эквивалентов рекомбинантной РНК вируса ТОРС в 1 мл исследуемого материала, или 10 ТЦД5(/мл вируса ТОРС в вируссодержащей жидкости. Испытания тест-системы на базе Пекинского института микробиологии и эпидемиологии показали, что диагностическая чувствительность тест-системы "АмплиСенс SARS" на клиническом материале от пациентов с предполагаемым диагнозом ТОРС составила 95%. При этом эффективность выявления в образцах фекалий была выше, чем в образцах мокроты (90 и 40% соответственно).
Заключение. В ЦНИИ эпидемиологии Минздрава РФ разработана тест-система "АмплиСенс SARS" для выявления РНК коронавируса, вызывающего ТОРС, методом обратной транскрипции и ПЦР в смывах из носо- и ротоглотки, мазках из носо- и ротоглотки, фекалиях и плазме крови. Тест-система включает реагенты для выделения РНК из клинического материала, получения кДНК на матрице РНК, проведения амплификации участка генома вируса ТОРС и электрофоретического анализа продуктов ПЦР и содержит рекомбинантные положительный и внутренний контрольные образцы, позволяющие контролировать эффективность проведения анализа. Испытания показали хорошие аналитические и диагностические характеристики тест-системы.
Ключевые слова
Об авторах
Г А Шипулин
ГУ ЦНИИ эпидемиологии Минздрава РФ; Научно-производственная лаборатория Федерального научно-методического центра СПИДМосква; ГУ ЦНИИ эпидемиологии Минздрава РФ; Научно-производственная лаборатория Федерального научно-методического центра СПИД
С Б Яцышина
ГУ ЦНИИ эпидемиологии Минздрава РФ; Научно-производственная лаборатория Федерального научно-методического центра СПИДМосква; ГУ ЦНИИ эпидемиологии Минздрава РФ; Научно-производственная лаборатория Федерального научно-методического центра СПИД
В П Чуланов
ГУ ЦНИИ эпидемиологии Минздрава РФ; Научно-производственная лаборатория Федерального научно-методического центра СПИДМосква; ГУ ЦНИИ эпидемиологии Минздрава РФ; Научно-производственная лаборатория Федерального научно-методического центра СПИД
М Ю Маркелов
ГУ ЦНИИ эпидемиологии Минздрава РФ; Научно-производственная лаборатория Федерального научно-методического центра СПИДМосква; ГУ ЦНИИ эпидемиологии Минздрава РФ; Научно-производственная лаборатория Федерального научно-методического центра СПИД
О Ю Шипулина
ГУ ЦНИИ эпидемиологии Минздрава РФ; Научно-производственная лаборатория Федерального научно-методического центра СПИДМосква; ГУ ЦНИИ эпидемиологии Минздрава РФ; Научно-производственная лаборатория Федерального научно-методического центра СПИД
А Т Подколзин
ГУ ЦНИИ эпидемиологии Минздрава РФ; Научно-производственная лаборатория Федерального научно-методического центра СПИДМосква; ГУ ЦНИИ эпидемиологии Минздрава РФ; Научно-производственная лаборатория Федерального научно-методического центра СПИД
Т С Астахова
ГУ ЦНИИ эпидемиологии Минздрава РФ; Научно-производственная лаборатория Федерального научно-методического центра СПИДМосква; ГУ ЦНИИ эпидемиологии Минздрава РФ; Научно-производственная лаборатория Федерального научно-методического центра СПИД
A Шишова
ГУ ЦНИИ эпидемиологии Минздрава РФ; Научно-производственная лаборатория Федерального научно-методического центра СПИДМосква; ГУ ЦНИИ эпидемиологии Минздрава РФ; Научно-производственная лаборатория Федерального научно-методического центра СПИД
- Wuchun Cao
Институт микробиологии и эпидемиологии Военно-медицинской академии Министерства обороны КитаяПекин; Институт микробиологии и эпидемиологии Военно-медицинской академии Министерства обороны Китая
- Liu Wei
Институт микробиологии и эпидемиологии Военно-медицинской академии Министерства обороны КитаяПекин; Институт микробиологии и эпидемиологии Военно-медицинской академии Министерства обороны Китая
- Fan Baochang
Институт микробиологии и эпидемиологии Военно-медицинской академии Министерства обороны КитаяПекин; Институт микробиологии и эпидемиологии Военно-медицинской академии Министерства обороны Китая
Список литературы
- Lee N., Hui D. S., Wu A. et al. A major outbreak of severe acute respiratory syndrome in Hong Kong. N. Engl. J. Med. 2003; 348: 1984-1994.
- Poutanen S. M., Low D. E., Henry B. et al. Identification of severe acute respiratory syndrome in Canada. N. Engl. J. Med. 2003; 348 (20): 1995-2005.
- Hsu L. Y., Lee С. С., Green J. A. et al. Severe acute respiratory syndrome in Singapore: clinical features of index patient and initial contacts. Emerg. Infect. Dis. 2003; 9 (6): 713-717.
- Murra M. A., Jones S. J. M., Astell С. R. et al. The genome sequence of the SARS-associated coronavirus. Science 2003; 300: 1399-1404.
- Uo L. K., Godeke G. J., Raamsman M. J. B. et al. Retargeting of coronavirus by substitution of the spike glycoprotein ectodomain: Crossing the host cell species barrier. J. Virol. 2000; 74 (3): 1393-1406.
- Virus taxonomy. Classification and nomenclature of viruses / van Regenmortel M. H. V. et al. New York: Academic Press; 2000.
- Rota P. A., Oberste M. S., Monroe S. S. et al. Characterization of a novel coronavirus associated with severe acute respiratory syndrome. Science 2003; 300: 1394-1399.
- Poland A. M., Vennema H., Foley J. E. et al. Two related strains of feline infectious peritonitis virus isolated from immunocompromised cats infected with a feline enteric coronavirus. J. Clin. Microbiol. 1996; 34 (2): 3180-3184.
- Peiris J. S. M., Chu С. М., Cheng V. С. С. Clinical progression and viral load in a community outbreak of coronavirus-associated SARS pneumonia: a prospective study. Lancet 2003; 36): 1767-1772.
- Worobey M., Holmes E. C. Evolutionary aspects of recombination in RNA viruses. J. Gen. Virol. 1999; 80: 2535-2543.
- Banner L. R., Lai M. M. Random nature of coronavirus RNA recombination in the absence of selection pressure. Virology 1991; 185 (1): 441-445.
- Boom R., Sol С. J. A., Salimans M. M. M. et al. Rapid and simple method for purification of nucleic acides. J. Clin. Microbiol. 1990; 28: 495-503.
Дополнительные файлы
