Выделение, очистка и кристаллизация ГТФазы Era из золотистого стафилококка

Обложка

Цитировать

Полный текст

Открытый доступ Открытый доступ
Доступ закрыт Доступ предоставлен
Доступ закрыт Только для подписчиков

Аннотация

Изучение кристаллической структуры белков является важным инструментом для разработки новых лекарств. Наиболее трудоемким этапом в получении структурных данных является выращивание хорошо дифрагирующих кристаллов белка. Представлены выделение, очистка и кристаллизация белка ГТФаза Era из патогенной бактерии золотистого стафилококка (Staphylococcus aureus). ГТФаза Era в клетках бактерий является одним из факторов сборки рибосомы. Фермент отвечает за рост и деление клетки, однако его структура мало изучена. Получены кристаллы белка Era из Staphylococcus aureus, которые могут быть использованы в дальнейших структурных исследованиях методом монокристального рентгеноструктурного анализа.

Ключевые слова

Об авторах

Э. А. Клочкова

Казанский (Приволжский) федеральныйKazan Federal University, Kazan, 420008 Russia университет

Email: k.usachev@kpfu.ru
Россия, Казань

Д. Р. Исламов

Казанский (Приволжский) федеральный университет

Email: k.usachev@kpfu.ru
Россия, Казань

А. Д. Биктимиров

Казанский (Приволжский) федеральный университет

Email: k.usachev@kpfu.ru
Россия, Казань

А. В. Рогачев

Московский физико-технический институт; Объединенный институт ядерных исследований

Email: k.usachev@kpfu.ru
Россия, Долгопрудный; Россия, Дубна

Ш. З. Валидов

Казанский (Приволжский) федеральный университет

Email: k.usachev@kpfu.ru
Россия, Казань

А. Г. Бикмуллин

Казанский (Приволжский) федеральный университет

Email: k.usachev@kpfu.ru
Россия, Казань

А. В. Симакин

Институт общей физики им. А.М. Прохорова РАН

Email: k.usachev@kpfu.ru
Россия, Москва

Г. С. Петерс

Национальный исследовательский центр “Курчатовский институт”

Email: k.usachev@kpfu.ru
Россия, Москва

М. М. Юсупов

Институт генетики, молекулярной и клеточной биологии

Email: k.usachev@kpfu.ru
Франция, Илькирш-Граффенштаден

К. С. Усачев

Казанский (Приволжский) федеральный университет

Автор, ответственный за переписку.
Email: k.usachev@kpfu.ru
Россия, Казань

Список литературы

  1. Stijn Blot R.N., Vandewoude K., Colardyn F. // N. Engl. J. Med. 1998. V. 339 (27). P. 2025. https://doi.org/10.1056/nejm199812313392716
  2. Jeljaszewicz J., Mlynarczyk G., Mlynarczyk A. // Int. J. Antimicrob. Agents. 2000. V. 16 (4). P. 473. https://doi.org/10.1016/S0924-8579(00)00289-2
  3. Fierobe L., Decré D., Mùller C. et al. // Clin. Infect. Dis. 1999. V. 29 (5). P. 1231. https://doi.org/10.1086/313454
  4. Shajani Z., Sykes M.T., Williamson J.R. // Annu. Rev. Biochem. 2011. V. 80. P. 501. https://doi.org/10.1146/annurev-biochem-062608-160432
  5. Kaczanowska M., Rydén-Aulin M. // Microbiol. Mol. Biol. Rev. 2007. V. 71 (3). P. 477. https://doi.org/10.1128/MMBR.00013-07
  6. Усачев К.С., Юсупов М.М., Валидов Ш.З. // Биохимия. 2020. Т. 85 (11). С. 1690. https://doi.org/10.1134/S0006297920110115
  7. Stern S., Powers T., Changchien L.I.-M., Noller H.F. // Science. 1989. V. 244 (4906). P. 783. https://doi.org/10.1126/science.2658053
  8. Davis J.H., Williamson J.R. // Philos. Trans. R. Soc. 2017. V. 372 (1716). Art. 20160181. https://doi.org/10.1098/rstb.2016.0181
  9. Bourne H.R. // Philos. Trans. R. Soc. 1995. V. 349 (1329). P. 283. https://doi.org/10.1098/rstb.1995.0114
  10. Tu C., Zhou X., Tropea J. et al. // Proc. Natl. Acad. Sci. U S A. 2009. V. 106 (35). P. 14843. https://doi.org/10.1073/pnas.0904032106
  11. Simon Goto, Akira Muto, Hyouta Himeno // J. Biochem. 2013. V. 153 (5). P. 403. https://doi.org/10.1093/jb/mvt022
  12. Ji X. // Postepy Biochem. 2016. V. 62 (3). P. 335.
  13. Xiaomei Zhou, Howard K. Peters III, Xintian Li et al. // J. Bacteriol. 2020. V. 202. P. 21. https://doi.org/10.1128/JB.00342-20
  14. Ren H., Liang Y., Li R. et al. // Acta Cryst. D. 2004. V. 60. P. 1292. https://doi.org/10.1107/S0907444904010467
  15. Meulenbroek E., Pannu N. // Acta Cryst. F. 2011. V. 68. P. 45. https://doi.org/10.1107/S1744309111045842
  16. Murugova T.N., Vlasov A.V., Ivankov O.I. et al. // J. Optoelectron. Adv. Mater. 2015. V. 17. P. 1397.
  17. Kabsch W. // Xds. Acta Cryst. D. 2010. V. 66. P. 125. https://doi.org/10.1107/S0907444909047337
  18. Chen X., Chen S.-M., Powell B. et al. // FEBS Lett. 1999. V. 445. P. 425. https://doi.org/10.1016/S0014-5793(99)00178-7
  19. Manalastas-Cantos K., Konarev P.V., Hajizadeh N.R. et al. // J. Appl. Cryst. 2021. V. 54. P. 343. https://doi.org/10.1107/S1600576720013412
  20. Jumper J., Evans R., Pritzel A. et al. // Nature. 2021. V. 596 (7873). P. 583.
  21. Chen X., Court D.L., Ji X. // PNAS. 1999. V. 15 (96). P. 8396. https://doi.org/10.1073/pnas.96.15.8396

Дополнительные файлы


© Российская академия наук, 2023